mRNA-seq (NGS) oo leh hiddo-side tixraac ah
RNA-seq waa qalab caadi ah oo ka jira cilmiga nolosha iyo dalagga, kaas oo isku xiraya farqiga u dhexeeya hiddo-sidayaasha iyo borotiinnada. Awooddiisu waxay ku jirtaa helitaanka qoraallada cusub iyo cabbiraadda muuqaalkooda hal tijaabo. Waxaa si weyn loogu isticmaalaa daraasadaha isbarbardhigga qoraalka, iftiiminta hidde-sideyaasha la xiriira sifooyin ama noocyo kala duwan, sida isbarbardhigga isbeddellada noocyada duurjoogta ah ama muujinta muujinta hidde-sideyaasha xaalado gaar ah. BMKCloud mRNA (Tixraaca) APP waxay isku daraysaa cabbirka muujinta, falanqaynta muujinta kala duwan (DEG), iyo falanqaynta qaab-dhismeedka taxanaha ee dhuumaha bioinformatics mRNA-seq (NGS) waxayna isku daraysaa awoodaha software-ka la midka ah, iyadoo hubinaysa ku habboonaanta iyo saaxiibtinimada isticmaalaha. Isticmaalayaashu waxay soo gelin karaan xogtooda RNA-seq daruurta, halkaas oo App-ku uu bixiyo xal falanqayn bioinformatic ah oo dhammaystiran. Intaa waxaa dheer, waxay mudnaanta siisaa khibradda macaamiisha, iyadoo bixinaysa hawlgallo shaqsiyeed oo loogu talagalay baahiyaha gaarka ah ee isticmaalayaasha. Isticmaalayaashu waxay dejin karaan xuduudaha oo ay u gudbin karaan hawlgalka dhuumaha iyaga keligood, hubin karaan warbixinta is-dhexgalka, arki karaan xogta/jaantusyada iyo macdan qodista xogta oo dhammaystiran, sida: xulashada hidda-wadaha bartilmaameedka, kooxaynta shaqaynta, jaantuska, iwm.
Madal:Illumina, MGI
Istaraatiijiyad:RNA-Seq
Qaab-dhismeedka: Daacadnimo, xog nadiif ah.
Nooca maktabadda:fr-unstrand, fr-firststrand ama fr-secondstrand
Dhererka akhriska:150 bp
Nooca faylka:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz ama *.fq.gz. Nidaamku wuxuu sameyn doonaasi toos ah ugu xidh faylasha .fastq iyadoo loo eegayo magacyada faylasha,tusaale ahaan *_1.fastq oo lagu daray *._2.fastq.
Tirada muunadaha:Ma jiraan wax xayiraad ah oo ku saabsan tiradamuunadaha, laakiin waqtiga falanqaynta ayaa kordhi doona marka tiradamuunado ayaa kordha.
Tirada Xogta Lagu Taliyay:6G muunad kasta
