Nikan- arin RNA Sequencing

Ilọsiwaju ni yiya sẹẹli ẹyọkan ati ilana iṣelọpọ ile ikawe ẹni kọọkan ni apapọ pẹlu ilana ṣiṣe-giga ngbanilaaye awọn iwadii ikosile jiini lori ipilẹ sẹẹli-nipasẹ-cell.O jẹ ki itupalẹ eto ti o jinlẹ ati pipe lori awọn olugbe sẹẹli ti o nipọn, ninu eyiti o yago fun boju-boju ti ilopọ wọn nipa gbigbe apapọ gbogbo awọn sẹẹli.

Bibẹẹkọ, diẹ ninu awọn sẹẹli ko dara lati ṣe si idaduro sẹẹli-ẹyọkan, nitorinaa awọn ọna igbaradi ayẹwo miiran - isediwon eeyan lati awọn tissu ni a nilo, iyẹn ni, a ti fa ekuro taara lati awọn tissues tabi sẹẹli ati pese sile sinu idadoro-orun kan fun ẹyọkan- sẹẹli lesese.

BMK n pese 10× Genomics ChromiumTM ti o da lori iṣẹ ṣiṣe atẹle sẹẹli-ẹyọkan RNA.Iṣẹ yii ti ni lilo pupọ ni awọn iwadii lori awọn iwadii ti o ni ibatan arun, gẹgẹbi iyatọ sẹẹli ti ajẹsara, ilopọ tumọ, idagbasoke ti ara, ati bẹbẹ lọ.

Chip transcriptome aaye: 10× Genomics

Platform: Illumina NovaSeq Platform

Pe wa

Awọn alaye Iṣẹ

Bioinformatics

Awọn abajade Ririnkiri

Ilana imọ-ẹrọ

Iyasọtọ ti awọn ekuro jẹ aṣeyọri nipasẹ 10 × Genomics Chromium TM, eyiti o ni eto microfluidics ikanni mẹjọ pẹlu awọn irekọja meji.Ninu eto yii, awọn ilẹkẹ gel kan pẹlu awọn koodu barcodes ati alakoko, awọn enzymu ati ẹyọkan kan ti wa ni idalẹnu ni iwọn epo nanoliter, ti o n ṣe Gel Bead-in-Emulsion (GEM).Ni kete ti GEM ti ṣẹda, lysis sẹẹli ati itusilẹ ti awọn koodu bar ni a ṣe ni GEM kọọkan.mRNA ti wa ni atunkọ sinu awọn ohun elo cDNA pẹlu awọn koodu barcode 10 × ati UMI, eyiti o jẹ koko-ọrọ siwaju si ikole ile-ikawe itẹlera boṣewa.

Tissue ko dara fun igbaradi idaduro sẹẹli kan

Ẹjẹ / Tissue	Idi
Yọ àsopọ tio tutunini	Ko le gba alabapade tabi awọn ajọ ti o fipamọ-pẹ
Awọn sẹẹli iṣan, Megakaryocyte, Ọra…	Iwọn sẹẹli ti tobi ju lati tẹ ohun elo naa sii
Ẹdọ…	Ẹlẹgẹ pupọ lati fọ, ko le ṣe iyatọ awọn sẹẹli ẹyọkan
Awọn sẹẹli Neuron, Ọpọlọ…	Ni ifarabalẹ diẹ sii, rọrun si aapọn, yoo yi awọn abajade atẹle naa pada
Pancreas, Tairodu…	Ọlọrọ ni awọn enzymu endogenous, ti o ni ipa lori iṣelọpọ ti idaduro sẹẹli kan

Nikan-nucleus vs Nikan-cell

Nikan-nucleus	Ẹyọ-ẹyọkan
Iwọn opin sẹẹli ailopin	Iwọn sẹẹli: 10-40 μm
Awọn ohun elo le jẹ aotoju àsopọ	Awọn ohun elo gbọdọ jẹ alabapade
Wahala kekere ti awọn sẹẹli tio tutunini	Itọju enzymu le fa aapọn aapọn sẹẹli
Ko si awọn sẹẹli ẹjẹ pupa lati yọ kuro	Awọn sẹẹli ẹjẹ pupa nilo lati yọ kuro
Iparun n ṣalaye bioinformation	Gbogbo sẹẹli n ṣalaye alaye bioin