mRNA-seq (NGS) pẹ̀lú ìtọ́kasí genome
RNA-seq jẹ́ irinṣẹ́ ìpele kan nínú ìmọ̀ sáyẹ́ǹsì ìgbésí ayé àti ti èso, ó ń so àlàfo láàrín àwọn genome àti proteomes pọ̀. Agbára rẹ̀ wà nínú wíwá àwọn àkọsílẹ̀ tuntun àti ṣíṣe ìwọ̀n ìfarahàn wọn nínú ìwádìí kan. A ń lò ó fún àwọn ìkẹ́kọ̀ọ́ ìfiwéra transcriptomic, tí ó ń tan ìmọ́lẹ̀ sí àwọn jiini tí ó ní í ṣe pẹ̀lú onírúurú ànímọ́ tàbí àwọn ànímọ́, bíi fífi àwọn mutant wéra pẹ̀lú àwọn irú ẹranko tàbí ṣíṣí ìfarahàn jiini lábẹ́ àwọn ipò pàtó kan. BMKCloud mRNA (Reference) APP ṣepọ ìwọ̀n ìfarahàn, ìṣàyẹ̀wò ìfarahàn ìyàtọ̀ (DEG), àti ìṣàyẹ̀wò ìṣètò ìpele sínú pílánẹ́ẹ̀tì bioinformatics mRNA-seq(NGS) ó sì so àwọn agbára ti sọ́fítíwọ́ọ̀kì tí ó jọra pọ̀, ó ń rí i dájú pé ó rọrùn àti pé ó rọrùn láti lò. Àwọn olùlò le gbé dátà RNA-seq wọn sórí ìkùukùu, níbi tí App náà ti ń fúnni ní ojútùú ìwádìí bioinformatic tí ó péye, tí ó dúró kan. Ní àfikún, ó ń ṣe àkóso ìrírí oníbàárà, ó ń fúnni ní àwọn iṣẹ́ àdáni tí a ṣe àgbékalẹ̀ rẹ̀ gẹ́gẹ́ bí àwọn àìní pàtó ti àwọn olùlò. Àwọn olùlò le ṣètò àwọn pàrámítà kí wọ́n sì fi iṣẹ́ pípín náà sílẹ̀ fúnra wọn, ṣàyẹ̀wò ìròyìn ìbánisọ̀rọ̀, wo dátà/àwòrán àti ìwakùsà dátà pípé, bíi: yíyan jínì àfojúsùn, ṣíṣàkójọpọ̀ iṣẹ́, àwòrán, àti bẹ́ẹ̀ bẹ́ẹ̀ lọ.
Pẹpẹ:Illumina, MGI
Ètò:RNA-Seq
Ìṣètò: Paried, mimọ-data.
Irú ibi ìkàwé:fr-unstrand, fr-firststrand tàbí fr-secondstrand
Gígùn kíkà:150 bp
Irú fáìlì:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz tàbí *.fq.gz. Ètò náà yóò ṣe bẹ́ẹ̀laifọwọyi so awọn faili .fastq pọ gẹgẹbi awọn orukọ faili wọn,fún àpẹẹrẹ *_1.fastq tí a so pọ̀ mọ́ *._2.fastq.
Iye awọn ayẹwo:Ko si awọn ihamọ lori nọmba naati awọn ayẹwo, ṣugbọn akoko itupalẹ yoo pọ si bi nọmbaawọn ayẹwo dagba.
Iye Data ti a ṣeduro:6G fún àpẹẹrẹ kọ̀ọ̀kan
