-
Sambandsgreining á erfðamengi
Erfðafræðileg tengslarannsókn (GWAS) miðar að því að greina erfðaafbrigði (arfgerð) sem tengjast sérstökum eiginleikum (svipgerð).GWAS rannsókn rannsakar erfðamerki sem fara yfir heilt erfðamengi fjölda einstaklinga og spáir fyrir um tengsl arfgerðar og svipgerða með tölfræðilegri greiningu á íbúastigi.Það hefur verið mikið notað í rannsóknum á sjúkdómum í mönnum og hagnýtri genanámu á flóknum eiginleikum dýra eða plantna.
-
Einkjarna RNA röðun
Framfarir í handtöku stakrar frumu og byggingartækni einstakra bókasafna í sameiningu við raðgreiningu með mikilli afköst gerir genatjáningarrannsóknum á frumu-fyrir-frumu grundvelli.Það gerir dýpri og fullkomna kerfisgreiningu á flóknum frumuhópum kleift, þar sem það forðast að mestu leyti að hylja misleitni þeirra með því að taka meðaltal allra frumna.
Sumar frumur henta hins vegar ekki til að búa til einfrumu sviflausn, þannig að aðrar aðferðir til undirbúnings sýna – nauðsynlegt er að draga kjarna úr vefjum, það er að segja að kjarni er dreginn beint úr vefjum eða frumu og útbúinn í einskjarna sviflausn fyrir einn-kjarna frumuröðun.
BMK veitir 10× Genomics ChromiumTM byggða einfrumu RNA raðgreiningarþjónustu.Þessi þjónusta hefur verið mikið notuð í rannsóknum á sjúkdómatengdum rannsóknum, svo sem aðgreiningu ónæmisfrumna, misleitni æxla, þróun vefja o.fl.
Spatial transcriptome chip: 10× Genomics
Pallur: Illumina NovaSeq pallur
-
Röðun heils genamengis plantna/dýra
Endurröðun alls erfðamengisins, einnig þekkt sem WGS, gerir kleift að sýna bæði algengar og sjaldgæfar stökkbreytingar á öllu erfðamenginu, þar með talið Single Nucleotide Polymorphism (SNP), Insertion Deletion (InDel), Structure Variation (SV) og Copy Number Variation (CNV) ).SV eru stærri hluti af breytileikagrunninum en SNP og hafa meiri áhrif á erfðamengið, sem hefur veruleg áhrif á lífverur.Langlestur endurröðun gerir ráð fyrir nákvæmari auðkenningu stórra brota og flókinna afbrigða vegna þess að langur lestur gerir það mun auðveldara að fara yfir flókin svæði á litningum eins og tandem endurtekningar, GC/AT-rík svæði og ofbreytileg svæði.
Pallur: Illumina, PacBio, Nanopore
-
BMKMANU S1000 Spatial Transcriptome
Staðbundið skipulag frumna gegnir mikilvægu hlutverki í ýmsum líffræðilegum ferlum, svo sem ónæmisíferð, þróun fósturvísa o.s.frv. Staðbundin umritaröðun, sem gefur til kynna genatjáningarsnið á sama tíma og geymir upplýsingar um staðbundna staðsetningu, hefur veitt mikla innsýn í vefjaarkitektúr á transcriptome-stigi.Með þróun tækninnar þarf að rannsaka ofurtæra formgerð vefja og raunverulegan byggingarmun á staðbundinni sameindatjáningu með hærri upplausn.BMKGENE veitir alhliða, einhliða staðbundna umritsröðunarþjónustu frá sýnum til líffræðilegrar innsýnar.
Staðbundin umritunartækni styrkti ný sjónarhorn á fjölbreyttum rannsóknarvettvangi með því að leysa upp genatjáningarsnið með staðbundnu innihaldi í ólíkum sýnum.
Staðbundin umritunarflís: BMKMANU S1000
Pallur: Illumina NovaSeq pallur
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
Visium Spatial Gene Expression er almenn staðbundin staðbundin transcriptome raðgreiningartækni til að flokka vefi út frá heildar mRNA.Kortleggðu allt umritið með formfræðilegu samhengi til að uppgötva nýja innsýn í eðlilegan þroska, meinafræði sjúkdóma og klínískar þýðingarrannsóknir.BMKGENE veitir alhliða, einhliða staðbundna umritsröðunarþjónustu frá sýnum til líffræðilegrar innsýnar.
Staðbundin umritunartækni styrkti ný sjónarhorn á fjölbreyttum rannsóknarvettvangi með því að leysa genatjáningarsnið með staðbundnu innihaldi í ólíkum sýnum.
Spatial transcriptome flís: 10x Genomics Visium
Pallur:Illumina NovaSeq pallur
-
Full-lengd mRNA Sequencing-Nanopore
RNA raðgreining hefur verið ómetanlegt tæki til yfirgripsmikilla umritagreininga.Eflaust hefur hefðbundin stuttlestraröð náð margvíslegri þróun hér.Engu að síður lendir það oft í takmörkunum við auðkenningu ísóforma í fullri lengd, magngreiningu, PCR hlutdrægni.
Nanopore raðgreining aðgreinir sig frá öðrum raðgreiningarpöllum að því leyti að kirni eru lesin beint án DNA nýmyndunar og mynda langan lestur við tugi kílóbasa.Þetta gerir kleift að lesa út yfir afrit í fullri lengd og takast á við áskoranirnar í rannsóknum á isoform-stigi.
Pallur：Nanopore PromethION
Bókasafn:cDNA-PCR
-
MRNA raðgreining í fullri lengd -PacBio
Nýjastaraðritun í fullri lengd, einnig þekkt semNýjastaIso-Seq nýtir sér kosti PacBio raðgreinar í lestrarlengd, sem gerir raðgreiningu cDNA sameinda í fullri lengd kleift án nokkurra hléa.Þetta kemur algjörlega í veg fyrir allar villur sem myndast í afritssamsetningarskrefum og smíðar samsett sett með upplausn á ísóformi.Þessi einingasett veitir öflugar erfðafræðilegar upplýsingar sem „viðmiðunarerfðamengi“ á umritunarstigi.Að auki, með því að sameina næstu kynslóðar raðgreiningargögn, gerir þessi þjónusta nákvæma magngreiningu á tjáningu á ísóformi.
Pallur: PacBio Sequel IIBókasafn: SMRT bjöllubókasafn -
Heilkjörnunga mRNA raðgreiningu-Illumina
mRNA raðgreining gerir kleift að greina öll mRNA sem umrituð eru úr frumum við sérstakar aðstæður.Það er öflug tækni til að sýna genatjáningarsnið, genabyggingu og sameindaferli ákveðinna líffræðilegra ferla.Hingað til hefur mRNA raðgreining verið mikið notuð í grunnrannsóknum, klínískri greiningu, lyfjaþróun o.s.frv.
Pallur: Illumina NovaSeq pallur
-
MRNA Sequencing-Illumina sem ekki byggir á tilvísun
mRNA raðgreining notar næstu kynslóðar raðgreiningartækni (NGS) til að fanga boðbera RNA(mRNA) mynd heilkjörnunga á ákveðnu tímabili sem sumar sérstakar aðgerðir eru að virkja.Lengsta afritið sem var splæst var kallað „Unigene“ og notað sem viðmiðunarröð fyrir síðari greiningu, sem er áhrifarík leið til að rannsaka sameindakerfi og stjórnkerfi tegundarinnar án tilvísunar.
Eftir samsetningu umritsgagna og samnýtingarfræðilegri skýringu
(1) SSR-greining, CDS-spá og genabygging verða forsköpuð.
(2) Framkvæmd verður magngreining á tjáningu frumefnis í hverju sýni.
(3) Mismunandi tjáð einingenes milli sýna (eða hópa) munu uppgötvast á grundvelli einingenatjáningar
(4) Framkvæmd verður þyrping, virkniskýring og auðgunargreining á mismunandi tjáðum einstofnum
-
Löng ókóðun raðgreining-Illumina
Löng ókóðun RNA (lncRNA) eru tegund RNA sameinda með lengd yfir 200 nt, sem einkennast af afar lágum kóðunarmöguleika.LncRNA, sem lykilþáttur í RNA sem ekki er kóða, er aðallega að finna í kjarna og plasma.Þróun í raðgreiningartækni og lífupplýsingafræði gerir kleift að bera kennsl á fjölda nýrra lncRNAs og tengja þau við líffræðilega virkni.Uppsöfnuð sönnunargögn benda til þess að lncRNA eigi víða þátt í stjórnun á erfðaefni, umritunarstjórnun og stjórnun eftir umritun.
-
Lítil RNA raðgreining-Illumina
Lítið RNA vísar til flokks RNA sameinda sem ekki eru kóðaðar sem venjulega eru minni en 200 nt að lengd, þar á meðal ör-RNA (miRNA), lítið truflunar-RNA (siRNA) og piwi-víxlverkandi RNA (piRNA).
MicroRNA (miRNA) er flokkur innræns lítils RNA með lengd um það bil 20-24nt, sem gegnir margvíslegum mikilvægum stjórnunarhlutverkum í frumum.miRNA tekur þátt í mörgum lífsferlum sem sýna vef - sértæka og stigs - sértæka tjáningu og mjög varðveitt í mismunandi tegundum.
-
circRNA raðgreiningu-Illumina
CircRNAs (Circular RNAs) eru einn flokkur RNA sameinda sem ekki eru kóðaðar og skortir 5′ endalok og 3′ enda poly(A) hala.CircRNAs framkvæma hringlaga uppbyggingu með samgildu tenginu sem er staða gegn RNA exonuclease meltingu.circRNA gegnir mikilvægu hlutverki í vexti og þroska lífvera og viðnám þeirra gegn ytra umhverfi.
CircRNA hefur margar aðgerðir, sem geta samkeppnishæft bundið miRNA, beitt stjórnunarhlutverki ceRNA, til að stjórna genatjáningu.Á undanförnum árum hefur einnig komið í ljós að það er nátengt tilkomu og þróun sjúkdóma og hefur mikla umsóknarhorfur í átt að sjúkdómsgreiningarmerkjum og svo framvegis.
