Hitakort
Hitakortsverkfærið tekur við fylkisgagnaskrá sem inntak og gerir notendum kleift að sía, staðla og flokka gögn. Helsta notkunartilfellið fyrir hitakort er klasagreining á genatjáningarstigi milli mismunandi sýna.
Genaskýringar
Genaskýringartólið framkvæmir genaskýringar byggðar á raðjöfnun FASTA-skráa á móti ýmsum gagnagrunnum.
Grunnt leitartól fyrir staðbundna röðun (BLAST)
BLAST tólið er BMKCloud-samþætt útgáfa af NCBI BLAST og hægt er að nota það til að framkvæma sömu aðgerðir með því að nota gögn sem hlaðið er upp á BMKCloud reikninginn.
CDS_UTR spá
Spátækið CDS_UTR er hannað til að spá fyrir um kóðunarsvæði (CDS) og ókóðunarsvæði (UTR) í tilteknum umritunarröðum byggt á BLAST niðurstöðum gegn þekktum próteingagnagrunnum og ORF spániðurstöðum.
Manhattan-lóðin
Manhattan Plot tólið gerir kleift að birta tilraunir með hátt úrtak og er almennt notað í erfðamengisvísindarannsóknum (GWAS).
Sirkusmynd
CIRCOS Diagram tólið býður upp á skilvirka myndræna mynd af því hvernig erfðaeiginleikar eru dreifðir um erfðamengið. Algengir eiginleikar eru meðal annars megindleg erfðafræðileg staðsetning, SNP, InDels, byggingarleg og afritafjöldi breytileikar.
Auðgun genafræðilegrar verufræði (GO)
GO Enrichment tólið býður upp á greiningu á virkni auðgunar. Helsta hugbúnaðurinn í þessu tóli er TopGO-Bioconductor pakkinn, sem inniheldur greiningu á mismunadreifingu, greiningu á GO auðgun og sjónræna birtingu niðurstaðna.
Vegin genasam-tjáningarnetgreining (WGCNA)
WGCNA er víða notuð gagnanámsaðferð til að uppgötva sam-tjáningareiningar gena. Hún er nothæf fyrir ýmis tjáningargögn, þar á meðal örflögur og NGS genatjáningargögn.
InterProScan
InterProScan tólið býður upp á greiningu og flokkun próteina með InterPro.
GO KEGG auðgun
GO KEGG auðgunartólið er hannað til að búa til GO auðgunarsúlurit, KEGG auðgunarsúlurit og KEGG auðgunarferil byggt á gefnu genasetti og samsvarandi skýringum.