Hitakort
Fylkisgagnaskrá er notuð til að teikna hitakort, sem getur síað, staðlað og flokkað fylkisgögn.Það er aðallega notað til klasagreiningar á genatjáningarstigi milli mismunandi sýna.
Genaskýring
Athugun á genavirkni er framkvæmd með því að kortleggja raðir í FASTA skrá á móti ýmsum gagnagrunni.
Genaskýring
Basic Local Alignation Search Tool
CDS_UTR_Spá
Þetta tól er hannað til að spá fyrir um kóða svæði (CDS) og ókóðun svæði (UTR) í tilteknum umritaröðum byggt á sprengingu gegn þekktum próteingagnagrunni og ORF spá.
Söguþráður Manhattan
Söguþráður Manhattan gerir kleift að sýna gögn með miklum fjölda gagnapunkta.Það er almennt notað í rannsóknum á erfðamengi-wide association studies (GWAS).
Circos
CIRCOS skýringarmynd gerir beina kynningu á SNP, InDeL, SV, CNV dreifingu á erfðamengi.
GO_Auðgun
TopGO er tól hannað til hagnýtrar auðgunar.TopGO-Bioconductor pakkinn samanstendur af mismunatjáningargreiningu, GO auðgunargreiningu og sjónrænni niðurstöðum.Það mun búa til möppu með úttak sem heitir "Graph", sem inniheldur niðurstöður fyrir topGO_BP, topGO_CC og topGO_MF.
WGCNA
WGCNA er mikið notuð gagnavinnsluaðferð til að uppgötva samtjáningareiningar gena.Það á við um ýmis tjáningargagnasett, þar á meðal örfylkisgögn og genatjáningargögn sem eru upprunnin frá næstu kynslóðar raðgreiningu.
InterProScan
InterPro próteinraðgreining og flokkun
GO_KEGG_Auðgun
Þetta tól er hannað til að búa til GO auðgunarsúlurrit, KEGG auðgunarsúlurrit og KEGG auðgunarferil byggt á uppgefnu genasetti og samsvarandi skýringu.