Vörur

Dreifkjörnunga RNA raðgreining

Dreifkjörnunga RNA raðgreining notar næstu kynslóðar raðgreiningu (NGS) til að sýna tilvist og magn RNA á tilteknu augnabliki, með því að greina breytt frumu umrit.Dreifkjörnunga RNA raðgreining fyrirtækisins okkar miðar sérstaklega að dreifkjörnungum með viðmiðunarerfðamengi, sem veitir þér umritunarsnið, greiningu á genabyggingu o.s.frv. Það hefur verið mikið notað við grunnvísindarannsóknir, lyfjarannsóknir og þróun og fleira.

Pallur: Illumina NovaSeq pallur

Hafðu samband við okkur

Upplýsingar um þjónustu

Þjónustulýsingar

Pallur: Illumina NovaSeq pallur, PE150

Tegund bókasafns: 350bp insert cDNA bókasafn (fer eftir hámarksdreifingu)

Röðunaraðferð: Pöruð enda 150 bp

Mælt er með gagnamagni: 2 Gb hrá gögn/sýni

Lífupplýsingafræði

(1) Gæðaeftirlit með raðgreiningargögnum: Núkleótíðdreifing, grunngæðadreifing, rRNA hlutfallsmat;

(2) Greining á röðun: Tölfræði um niðurstöður jöfnunar, mettun á röðun, Umfjöllun um röðun;

(3) Tilvísun erfðamengisskýringar (NR, Swiss-Prot, Pfam, COG, GO, KEGG);

(4) Tjáningargreining: Tjáningardreifing (Með tveimur eða fleiri sýnum), Greining á tjáningu milli sýna (Venngreining, Fylgnigreining, PCA greining);

(5) Mismunatjáningargreining (Með tveimur eða fleiri sýnum);

(6) Greining á genamengi: Venngreining, Klasagreining, Aðgerðarskýringargreining (COG, GO, KEGG), Aðgerðarauðgunargreining (GO, KEGG), Hreyfingarrit virkniauðgunar, Ipath greining;

(7) sRNA-greining: sRNA-spá, sRNA-skýring (Blast, sRNAMap, sRNATarBase, SIPHT, Rfam), sRNA-efri uppbyggingu spá, sRNA-markgenaspá;

(8) Uppskriftargreining: Operóngreining, Uppskrift upphafs- og lokastaðaspá, UTR skýring og greining, spá um röð frumkvöðla, SNP/InDel greining (SNP/InDel skýring, SNP/InDel svæðisdreifing, SNP tölfræði).