●Einangrun og ræktunarlaus aðferð fyrir örverusnið: Virkja raðgreining á erfðaefni frá óræktanlegum lífverum.
●Háupplausn: Uppgötvaðu tegundir með litlum fíkniefni í umhverfissýnum.
●Alhliða greining á lífupplýsingum:Einbeitt ekki aðeins að flokkunarfræðilegum fjölbreytileika heldur einnig á virkni fjölbreytileika samfélagsins.
●Víðtæk reynsla:Með því að ná árangri um að loka mörgum Metagenomics verkefnum með góðum árangri á ýmsum rannsóknarsviðum og vinna yfir 200.000 sýni, fær teymið okkar mikla reynslu í hvert verkefni.
Röðunarpallur | Röðunarstefna | Mælt er með gögnum | Gæðaeftirlit |
Illumina Novaseq eða Dnbseq-T7 | PE150 | 6-20GB | Q30 ≥85% |
Styrkur (ng/µL) | Heildarupphæð (ng) | Rúmmál (µl) |
≥1 | ≥30 | ≥20 |
● Jarðvegur/seyru: 2-3g
● Innihald í þörmum: 0,5-2g
● Innihald í þörmum: 0,1-0,25g
● Yfirborð plantna (auðgað seti): 0,5-1g
● Gerjun seyði auðgað botnfall): 0,2-0,5g
● saur (stór dýr): 0,5-2g
● saur (mús): 3-5grain
● lungnablöðruholvökvi: síupappír
● Vaginal þurrkur: 5-6 þurrkur
● Húð/kynfærþurrkur/munnvatn/mjúkvef til inntöku/koki
● Yfirborðs örverur: 5-6 þurrkar
● Waterbody/Air/Biofilm: Sía pappír
● Endophytes: 2-3g
● Dental Plaque: 0,5-1g
Inniheldur eftirfarandi greiningu:
● Röðunargæðaeftirlit gagna
● Metagenome samsetning og genspá
● Genaskýring
● Taxonomic alfa fjölbreytni greining
● Virk greining samfélagsins: Líffræðileg virkni, efnaskipta, sýklalyfjaónæmi
● Greining á bæði hagnýtum og flokkunarfræðilegum fjölbreytileika:
Beta fjölbreytileikagreining
Greining milli hópa
Fylgnagreining: Milli umhverfisþátta og samsetningar og fjölbreytni
Virk greining: Kort sýklalyfjaónæmi
Mismunandi greining á efnaskiptaferlum KEGG: hitakort um verulegar leiðir
Alfa fjölbreytni í flokkunarfræðilegri dreifingu: Ace Index
Beta fjölbreytni í flokkunarfræðilegri dreifingu: PCOA
Kannaðu framfarir sem auðveldar með Metagenome raðgreiningarþjónustu BMKGENE með Illumina með sýningarstýrðu safni útgáfna.
Hai, Q. o.fl. (2023) 'Metagenomic og umbrotsgreining á breytingum á þörmum innihalds regnbogasilungs (Oncorhynchus mykiss) smituð með smitandi blóðmyndandi drepveiru við mismunandi ræktun vatnshitastigs',Landamæri í örverufræði, 14, bls. 1275649. DOI: 10.3389/FMICB.2023.1275649.
Mao, C. o.fl. (2023) 'Örverusamfélög, viðnám gen og viðnám áhættu í þéttbýlisvötnum af mismunandi trophic ríkjum: innri tenglar og ytri áhrif',Journal of Duritous Materials Advances, 9, bls. 100233. DOI: 10.1016/j.hazadv.2023.100233.
Su, M. o.fl. (2022) „Metagenomic greining leiddi í ljós mun á samsetningu og virkni milli vökvatengdra og fastra örvera í sauðfjárhræðslu“,Landamæri í örverufræði, 13, bls. 851567. DOI: 10.3389/FMICB.2022.851567.
Yin, J. o.fl. (2023) 'Offitusjúklingar ningxiang svínafleiddir örveru endurstrengir umbrot karnitíns til að stuðla að vöðva fitusýru í mjóum dly svínum',Nýsköpunin, 4 (5), bls. 100486. DOI: 10.1016/j.xinn.2023.100486.
Zhao, X. o.fl. (2023) 'Metagenomic innsýn í hugsanlega áhættu af dæmigerðu lífríki/óbrjótanlegu plasti og ekki plast rusli í efri og neðri hluta Haihe árós, Kína',Vísindi í heildarumhverfinu, 887, bls. 164026. DOI: 10.1016/j.scitotenv.2023.164026.