mRNA-raðgreining (NGS) með viðmiðunarerfðamengi
RNA-seq er staðlað tól í lífvísindum og ræktunarvísindum, sem brúar bilið milli erfðamengis og próteóma. Styrkur þess liggur í því að uppgötva nýjar umritanir og magngreina tjáningu þeirra í einni greiningu. Það er mikið notað til samanburðarrannsókna á umritun, varpar ljósi á gen sem tengjast ýmsum eiginleikum eða svipgerðum, eins og að bera saman stökkbreyttar erfðabreyttur við villtar gerðir eða afhjúpa genatjáningu við tilteknar aðstæður. BMKCloud mRNA(Reference) APP samþættir magngreiningu tjáningar, mismunandi tjáningargreiningu (DEG) og raðbyggingargreiningar í mRNA-seq(NGS) lífupplýsingaleiðsluna og sameinar styrkleika svipaðs hugbúnaðar, sem tryggir þægindi og notendavænni. Notendur geta hlaðið RNA-seq gögnum sínum inn í skýið, þar sem appið býður upp á alhliða, heildstæða lausn fyrir lífupplýsingagreiningu. Að auki forgangsraðar það upplifun viðskiptavina og býður upp á sérsniðnar aðgerðir sem eru sniðnar að þörfum notenda. Notendur geta stillt breytur og sent inn verkefnið sjálfir, skoðað gagnvirka skýrslu, skoðað gögn/skýringarmyndir og lokið gagnanámi, svo sem: val á markgenum, virkniþyrpingum, skýringarmyndum o.s.frv.
Pallur:Illumina, MGI
Stefna:RNA-raðgreining
Útlit: Parað, hrein gögn.
Tegund bókasafns:fr-óþáttaður, fr-fyrsti þáttur eða fr-annar þáttur
Lestrarlengd:150 bp
Skráartegund:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz eða *.fq.gz. Kerfið munpara .fastq skrárnar sjálfkrafa saman eftir skráarnafnum þeirra,t.d. *_1.fastq parað við *._2.fastq.
Fjöldi sýna:Engar takmarkanir eru á fjöldanumaf sýnum, en greiningartíminn mun lengjast eftir því sem fjöldisýnin vex.
Ráðlagður gagnamagn:6G á hvert sýni
