Heildar umritaröðun – Illumina
Eiginleikar
● Tvöfalt safn til að raða öllu umritinu: rRNA eyðing fylgt eftir með PE150 bókasafns undirbúningi og stærðarvali fylgt eftir með SE50 bókasafns undirbúningi
● Ljúka lífupplýsingagreiningu á mRNA, lncRNA, circRNA og miRNA í aðskildum lífupplýsingaskýrslum
● Sameiginleg greining á allri RNA tjáningu í samsettri skýrslu, þar með talið ceRNA netgreiningu.
Þjónustukostir
●Ítarleg greining á eftirlitsnetum: ceRNA netgreining er virkjuð með sameiginlegri raðgreiningu mRNA, lncRNA, circRNA og miRNA og með tæmandi lífupplýsingavinnuflæði.
●Alhliða skýring: við notum marga gagnagrunna til að skýra skilmerkilega tjáð gen (DEGs) og framkvæma samsvarandi auðgunargreiningu, sem veitir innsýn í frumu- og sameindaferla sem liggja að baki umritssvöruninni.
●Víðtæk sérfræðiþekking: Með afrekaskrá með að loka yfir 2000 heilum umritunarverkefnum á ýmsum rannsóknarsviðum, færir teymið okkar mikla reynslu í hvert verkefni.
●Strangt gæðaeftirlit: við innleiðum kjarnastýringarpunkta á öllum stigum, frá undirbúningi sýna og bókasafns til raðgreiningar og lífupplýsingafræði.Þetta nákvæma eftirlit tryggir afhendingu stöðugt hágæða niðurstöður.
● Alhliða skýring: við notum marga gagnagrunna til að skýra skilmerkilega tjáð gen (DEGs) og framkvæma samsvarandi auðgunargreiningu, sem veitir innsýn í frumu- og sameindaferla sem liggja að baki umritssvöruninni.
●Stuðningur eftir sölu: Skuldbinding okkar nær út fyrir verklok með 3ja mánaða þjónustutíma eftir sölu.Á þessum tíma bjóðum við upp á eftirfylgni verkefna, aðstoð við bilanaleit og spurningar og svör til að svara öllum fyrirspurnum sem tengjast niðurstöðunum
Dæmi um kröfur og afhending
| Bókasafn | Röðunarstefna | Mælt er með gögnum | Gæðaeftirlit |
| rRNA tæmd | Illumina PE150 | 16 Gb | Q30≥85% |
| Stærð valin | Illumina SE50 | 10-20M lestur |
Dæmi um kröfur:
Núkleótíð:
| Styrkur (ng/μl) | Magn (μg) | Hreinleiki | Heiðarleiki |
| ≥ 100 | ≥ 1 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Takmörkuð eða engin prótein- eða DNA mengun sýnd á hlaupi. | Plöntur: RIN≥6,5 Dýr: RIN≥7,0 5,0≥28S/18S≥1,0; takmörkuð eða engin grunnhækkun |
Mælt er með sýnishornafhendingu
Ílát:
2 ml miðflóttahólkur (ekki mælt með álpappír)
Merking sýnis: Hópur+afrit td A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Sending:
1.Þurrís: Pakka þarf sýnum í poka og grafa í þurrís.
2.RNAstable glös: Hægt er að þurrka RNA sýni í RNA stöðugleikaglasi (td RNAstable®) og senda við stofuhita.
Þjónustuvinnuflæði
Hönnun tilrauna
Sýnishorn afhending
RNA útdráttur
Bókasafnsbygging
Röðun
Gagnagreining
Þjónusta eftir sölu
Lífupplýsingafræði
Yfirlit yfir RNA tjáningu
Mismunandi tjáð gen
ceRNA greiningu
Mismunandi tjáð miRNA og skyld RNA
Kannaðu framfarirnar í rannsóknum sem BMKGene auðveldar allri transcriptome raðgreiningarþjónustu í gegnum safn rita.
Dai, Y. o.fl.(2022) „Alhliða tjáningarsnið mRNA, lncRNA og miRNA í Kashin-Beck sjúkdómi auðkennd með RNA-raðgreiningu“, Molecular Omics, 18(2), bls. 154–166.doi: 10.1039/D1MO00370D.
Liu, N. nan o.fl.(2022) „Uppskriftargreining í fullri lengd á kuldaþoli Apis cerana í Changbai-fjalli á vetrartímabili.“, Gene, 830, bls. 146503–146503.doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
Wang, XJ o.fl.(2022) 'Multi-Omics samþættingu-Based Forgangsröðun samkeppnishæfra innrænna RNA reglugerðarneta í smáfrumulungnakrabbameini: sameindaeiginleikar og lyfjaframbjóðendur', Frontiers in Oncology, 12, bls.904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xu, P. o.fl.(2022) „Samþætt greining á lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA tjáningarsniðum sýnir nýja innsýn í hugsanlega aðferðir til að bregðast við rótarhnetum í hnetum“, BMC Genomics, 23(1), bls. 1–12.doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/MYNDIR/7.
Yan, Z. o.fl.(2022) „Raðgreining á heilum umritum RNA undirstrikar sameindaaðferðirnar sem tengjast viðhaldi gæðum eftir uppskeru í spergilkáli með rauðri LED geislun“, Postharvest Biology and Technology, 188, bls.111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
