Uzoq kodlashsiz ketma-ketlik-Illumina
Xizmat afzalliklari
●mRNK va lncRNKni birgalikda tahlil qilish: mRNK transkriptlarining miqdorini aniqlashni lncRNK va ularning maqsadlarini o'rganish bilan birlashtirib, hujayrali javob asosida yotgan tartibga solish mexanizmi haqida chuqur ma'lumot olish mumkin.
●Keng ekspertiza: Biz turli xil namunalar va loyihalar maqsadlarini qamrab olgan 230 000 dan ortiq namunalarni qayta ishladik. Biz har bir loyihaga tajriba boyligini keltiramiz.
●mRNK va lncRNKni birgalikda tahlil qilish: Biz mRNK transkriptlarining miqdorini aniqlashni lncRNA va ularning maqsadlarini o'rganish bilan birlashtiramiz, bu esa hujayra javobi asosidagi tartibga solish mexanizmi haqida chuqur ma'lumot olish imkonini beradi.
●Qattiq sifat nazorati: Namuna tayyorlashdan tortib kutubxona tayyorlash, ketma-ketlik va bioinformatika kabi barcha bosqichlarda asosiy nazorat nuqtalarini amalga oshiramiz. Bizning sinchkovlik bilan monitoringimiz doimiy ravishda yuqori sifatli natijalarni taqdim etishni ta'minlaydi.
●Keng qamrovli izoh: Differentsial ifodalangan genlarni (DEG) funktsional izohlash va tegishli boyitish tahlillarini amalga oshirish uchun bir nechta ma'lumotlar bazalaridan foydalanamiz. Ushbu keng qamrovli yondashuv transkriptome javobi asosida yotgan hujayra va molekulyar jarayonlar haqida tushuncha beradi, bu sizning tajribangiz ma'lumotlari haqida barcha mumkin bo'lgan ma'lumotlarni olishingizni ta'minlaydi.
●Sotishdan keyingi yordam: Biz hozir bo'lish qanchalik muhimligini tushunamiz, shuning uchun bizning majburiyatimiz sotuvdan keyingi 3 oylik xizmat ko'rsatish muddati bilan loyihani yakunlashdan tashqariga chiqadi. Shu vaqt ichida biz natijalar bilan bog'liq har qanday so'rovlarni hal qilish uchun loyihani kuzatish, muammolarni bartaraf etish bo'yicha yordam va savol-javob seanslarini taklif qilamiz.
Namuna talablari va yetkazib berish
| Kutubxona | Platforma | Tavsiya etilgan maʼlumotlar | Ma'lumotlar QC |
| rRNK yo'nalish kutubxonasi tugadi | Illumina PE150 | 10-16 Gb | Q30≥85% |
Nukleotidlar:
| Kons.(ng/ml) | Miqdori (mkg) | Poklik | Butunlik |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Jelda ko'rsatilgan protein yoki DNK ifloslanishi cheklangan yoki yo'q. | RIN≥6,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; cheklangan yoki asosiy balandlikning yo'qligi |
● O‘simliklar:
Ildiz, poya yoki gulbarg: 450 mg
Barg yoki urug': 300 mg
Meva: 1,2 g
● Hayvon:
Yurak yoki ichak: 450 mg
Ichki organlar yoki miya: 240 mg
Mushaklar: 600 mg
Suyaklar, soch yoki teri: 1,5 g
● Artropodlar:
Hasharotlar: 9 g
Qisqichbaqasimonlar: 450 mg
● To'liq qon:2 naycha
● Hujayralar: 106 hujayralar
● Sarum va plazma: 6 ml
Tavsiya etilgan namuna yetkazib berish
Idish: 2 ml santrifüj naychasi (qalay folga tavsiya etilmaydi)
Namuna belgilari: Guruh+takrorlash, masalan, A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Yuk tashish:
1. Quruq muz: namunalar qoplarga solib, quruq muzga ko'milishi kerak.
2. RNK barqaror naychalar: RNK namunalari RNK stabilizatsiya trubkasida (masalan, RNAstable®) quritilishi va xona haroratida yuborilishi mumkin.
Xizmat ish oqimi
Tajriba dizayni
Namuna yetkazib berish
RNK ekstraktsiyasi
Kutubxona qurilishi
Ketma-ketlik
Ma'lumotlarni tahlil qilish
Sotishdan keyingi xizmatlar
Bioinformatika
- Xom ma'lumotlar
- Ma'lumotlar QC
- Genomning moslashuvi
- Gen tuzilishi (alternativ birlashma, gen tuzilishini optimallashtirish va yangi genlarni bashorat qilish)
- Gen ifodasini aniqlash
- Differensial ifoda tahlili
- DEG izohi va boyitish + Differensial ifodalangan lncRNA maqsadli genlari
- Transkriptni aniqlash
- lncRNA identifikatsiyasi (lncRNA saqlanishi va ma'lum lncRNA)
- lncRNA maqsadli genlarni bashorat qilish
- lncRNA ifoda miqdorini aniqlash
- mRNK ma'lumotlari bilan birgalikda tahlil qilish
Differensial gen ekspressiyasi (DEGs) tahlili
LncRNA ifodasini miqdoriy aniqlash - klasterlash
lncRNA maqsadli genlarini boyitish
Birgalikda mRNK va lncRNA pozitsiyasini tahlil qilish - Circos syujeti (o'rta doira mRNK va ichki sikrlce lncRNA)
BMKGene-ning lncRNA tenglashtirish xizmatlari tomonidan yaratilgan yutuqlarni saralangan nashrlar to'plami orqali o'rganing.
Ji, H. va boshqalar. (2020) "Kalamushlar jigarida sovuq stress bilan bog'liq lncRNAlarni aniqlash, funktsional bashorat qilish va asosiy lncRNA tekshiruvi",Ilmiy hisobotlar2020 10:1, 10(1), 1–14-betlar. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. va boshqalar. (2021) "Integratsion transkriptomik tahlil CyHV-3-ga chidamli oddiy sazan shtammi uchun immunitet mexanizmini ochib beradi",Immunologiyada chegaralar, 12, p. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Vang, XJ va boshqalar. (2022) "Kichik hujayrali o'pka saratonida raqobatdosh endogen RNKni tartibga solish tarmoqlarining ko'p omiks integratsiyasiga asoslangan ustuvorligi: molekulyar xususiyatlar va giyohvand moddalarga nomzodlar",Onkologiyada chegaralar, 12, p. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xiao, L. va boshqalar. (2020) 'Populusda fotosintez asosida yotgan gen koekspressiya tarmog'ining genetik diseksiyasi',O'simliklar biotexnologiyasi jurnali, 18(4), 1015–1026-betlar. doi: 10.1111/PBI.13270.
Zheng, H. va boshqalar. (2022) "Graves kasalligi va Hashimoto tiroiditi mikro muhitida immunitet hujayralarida tartibga solinmagan gen ekspressiyasi va anormal metabolik signalizatsiya uchun global tartibga solish tarmog'i",Immunologiyada chegaralar, 13, p. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
