Mahsulotlar

O'simlik/hayvonlarning butun genomini ketma-ketlashtirish

O'simlik/hayvonning butun genomini ketma-ketlashtirish tavsiya etilgan rasm

Butun genomni qayta tartiblash, shuningdek, WGS sifatida ham tanilgan, butun genomda umumiy va kam uchraydigan mutatsiyalarni, shu jumladan bitta nukleotid polimorfizmi (SNP), kiritishni o'chirish (InDel), tuzilma o'zgarishi (SV) va nusxa ko'chirish sonining o'zgarishini (CNV) aniqlash imkonini beradi. ).SV lar SNP larga qaraganda o'zgaruvchanlik bazasining katta qismini tashkil qiladi va tirik organizmlarga sezilarli ta'sir ko'rsatadigan genomga ko'proq ta'sir qiladi.Uzoq vaqt davomida o'qilgan qayta tartiblash katta bo'laklarni va murakkab o'zgarishlarni aniqroq aniqlash imkonini beradi, chunki uzoq o'qishlar tandem takrorlari, GC/ATga boy hududlar va giper-o'zgaruvchan hududlar kabi murakkab hududlar bo'ylab xromosoma kesishishini ancha osonlashtiradi.

Platforma: Illumina, PacBio, Nanopore

Biz bilan bog'lanish

Xizmat tafsilotlari

Demo natijasi

Tanlangan nashr

1.Xizmatning afzalliklari

1000 dan ortiq turlar uchun genom ketma-ketligi bo'yicha katta tajriba.

4000 dan ortiq to'plangan ta'sir koeffitsienti bilan 800 dan ortiq nashr etilgan holatlar.

Variantlarni chaqirish va funktsiyalarni tahlil qilish bo'yicha keng qamrovli bioinformatika tahlili.

2. Xizmat spetsifikatsiyalari

Platforma		Kutubxona	Tavsiya etilgan ketma-ketlik chuqurligi
Illumina		PE 150	SNP uchun InDel chaqiruvi ≥ 10x SV uchun CNY chaqiruvi ≥ 30x
Nanopor		8 kb	SV uchun CNY chaqiruvi ≥ 20x
Pacbio	CCS	15 kb	SNP, InDel, SV, CNY qo'ng'iroqlari uchun ≥ 10x

3. Namunaviy talablar

Platforma		Kons.(ng/μL)	Miqdori (ng)	Tozalik		Agaroz jeli
				OD260/280	OD260/230	1. Yo'q yoki cheklangan holda asosiy tarmoqni tozalangjelda degradatsiya kuzatiladi. 2. RNK yoki oqsil bilan ifloslanish yo'q yoki cheklangan
Illumina		≥1	≥30	-	-
Nanopor		≥30	Ma'lumotlarning chiqishiga bog'liq 10 mkg / hujayra	1.7-2.2	≥1,5
Pacbio	CCS	≥50		1.7-2.2	1,8-2,5

4. Bioaxborot tahlili

5. Xizmatning ish oqimi

Namuna yetkazib berish

DNK ekstraktsiyasi

Kutubxona qurilishi

Ketma-ketlik

Ma'lumotlarni tahlil qilish

Ma'lumotlarni yetkazib berish

Oldingi: BMKMANU S1000 fazoviy transkriptom

Keyingisi: Bir yadroli RNK ketma-ketligi

1) Genom xaritalash statistikasi

1-jadval Xaritalash natijasi statistikasi

1-rasm Qo'shish hajmi va o'qishlar qamrovini taqsimlash.

2) Variantlarni aniqlash

Shakl 2 Namunalar orasida SNP/INDEL/SV statistikasi va izohi

3-rasm O'zgarishlarning genom bo'ylab taqsimlanishi

3) Variatsiyalarning funksional annotatsiyasi

2019	Tabiat aloqalari	Butun genomning qayta sekvensiyasi Brassica napusning kelib chiqishi va uning takomillashuvida ishtirok etgan genetik lokuslarni ochib beradi.
2020	PNAS	Oltin baliqning evolyutsion kelib chiqishi va xonakilashtirish tarixi (Carassius auratus)
2021 yil	O'simliklar biotexnologiyasi jurnali	Ikki o'stiriladigan jut turlarining mos yozuvlar genomlari
2021 yil	O'simliklar biotexnologiyasi jurnali	Brassicajuncea o'simlik va moyli o'simlik allopoliploidining genomik belgilari va glyukozinolatlarning to'planishini nazorat qiluvchi genetik lokuslar
2019	Molekulyar o'simlik	Butun dunyo bo'ylab kolza qo'shilishlari to'plamining butun genomini qayta sekvensiyasi ularning ekotiplari farqlanishining genetik asoslarini ochib beradi.
2022	Bog'dorchilik bo'yicha tadqiqotlar	Genom bo'yicha assotsiatsiyalar tahlili tarvuz urug'i hajmining tabiiy o'zgarishi haqida molekulyar tushunchalarni beradi.
2021 yil	Eksperimental botanika jurnali	Genom bo'yicha assotsiatsiya tadqiqoti paxtada sovuqqa chidamlilikni ta'minlovchi GhSAD1 variantlarini aniqlaydi
2021 yil	Eksperimental botanika jurnali	Genom bo'ylab assotsiatsiyani o'rganish va transkriptomani taqqoslash kolzada gulbarg hajmini boshqaradigan yangi QTL va nomzod genlarini aniqlaydi.