איין-קערן רנאַ סיקוואַנסינג
טעכניש פּרינציפּ
די אפגעזונדערטקייט פון נוקליי איז אַטשיווד דורך 10 × Genomics Chromium TM, וואָס באשטייט אַכט-קאַנאַל מיקראָפלוידיקס סיסטעם מיט טאָפּל קראָסינגז.אין דעם סיסטעם, אַ געל קרעלן מיט באַרקאָדעס און אָנפאַנגער, ענזימעס און אַ איין קערן זענען ענקאַפּסאַלייטיד אין נאַנאָליטער-סייזד ייל קאַפּ, דזשענערייטינג געל קרעלן-אין-עמולסיאָן (געם).אַמאָל יידלשטיין זענען געשאפן, צעל ליסיס און מעלדונג פון באַרקאָדעס זענען דורכגעקאָכט אין יעדער יידלשטיין.mRNA זענען פאַרקערט טראַנסקריבעד אין cDNA מאַלאַקיולז מיט 10 × באַרקאָדעס און UMI, וואָס זענען ווייטער אונטערטעניק צו נאָרמאַל סיקוואַנסינג ביבליאָטעק קאַנסטראַקשאַן.
די געוועב איז נישט פּאַסיק פֿאַר צוגרייטונג פון איין צעל סאַספּענשאַן
| צעל / געוועב | סיבה |
| ונפרעש פאַרפרוירן געוועב | ניט געקענט באַקומען פריש אָדער לאַנג-געראטעוועט אָרגאַנאַזיישאַנז |
| מוסקל צעל, מעגאַקאַריאָסיטע, פעט ... | צעל דיאַמעטער איז צו גרויס צו אַרייַן די קיילע |
| לעבער... | צו שוואַך צו ברעכן, ניט געקענט צו ויסטיילן איין סעלז |
| נעוראָן צעל, מאַרך ... | מער שפּירעוודיק, גרינג צו דרוק, וועט טוישן די סיקוואַנסינג רעזולטאַטן |
| פּאַנקרעאַס, טיירויד ... | רייַך אין ענדאָגענאָוס ענזימעס, אַפעקטינג די פּראָדוקציע פון איין צעל סאַספּענשאַן |
איין-קערן ווס איין-צעל
| איין-קערן | איין-צעל |
| ונלימיטעד צעל דיאַמעטער | צעל דיאַמעטער: 10-40 μם |
| דער מאַטעריאַל קענען זיין פאַרפרוירן געוועב | דער מאַטעריאַל מוזן זיין פריש געוועב |
| נידעריק דרוק פון פאַרפרוירן סעלז | ענזיים באַהאַנדלונג קען פאַרשאַפן צעל דרוק אָפּרוף |
| קיין רויט בלוט סעלז דאַרפֿן צו זיין אַוועקגענומען | רויט בלוט סעלז דאַרפֿן צו זיין אַוועקגענומען |
| יאָדער יקספּרעסז ביאָאינפֿאָרמאַציע | די גאנצע צעל יקספּרעסאַז ביאָאינפֿאָרמאַציע |
סערוויס ספּעסאַפאַקיישאַנז
| ביבליאָטעק | סיקוואַנסינג סטראַטעגיע | דאַטאַ באנד | מוסטער רעקווירעמענץ | געוועב |
| 10× גענאָמיקס איין-נוקליי ביבליאָטעק | 10x Genomics -Illumina PE150 | 100,000 לייענען / צעל בעערעך.100-200 גיגאבייט | צעל נומער:>2×105 צעל קאָנס.אין 700-1,200 צעל / μ ל | ≥ 200 מג |
פֿאַר מער דעטאַילס וועגן מוסטער צוגרייטונג גיידאַנס און סערוויס וואָרקפלאָוו, ביטע פילן פריי צו רעדן צו אַBMKGENE מומחה
סערוויס אַרבעט לויפן
עקספּערימענט פּלאַן
מוסטער עקספּרעס
נוקלעי אפגעזונדערטקייט
ביבליאָטעק קאַנסטראַקשאַן
סיקוואַנסינג
דאַטאַ אַנאַליסיס
נאָך-פאַרקויף באַדינונגען
1.ספּאָט קלאַסטערינג
2.מאַרקער אויסדרוק זעט קלאַסטערינג העאַטמאַפּ
3.מאַקער דזשין פאַרשפּרייטונג אין פאַרשידענע קלאַסטערז
4.צעל טרייַעקטאָריע אַנאַליסיס / פּסעוודאָטימע
