-
Analiza e Shoqatës së Gjenomit
Studimi i shoqatës së gjenomit (GWAS) synon të identifikojë variantet gjenetike (gjenotip) që lidhen me tipare specifike (fenotip).Studimi GWAS heton shënuesit gjenetikë të kryqëzuar të gjenomit të një numri të madh individësh dhe parashikon lidhjet gjenotip-fenotip me anë të analizave statistikore në nivel popullate.Është aplikuar gjerësisht në kërkimet mbi sëmundjet njerëzore dhe minierat funksionale të gjeneve në tipare komplekse të kafshëve ose bimëve.
-
Sekuenca e ARN-së me një bërthamë
Përparimi në kapjen e një qelize të vetme dhe teknikën e ndërtimit të bibliotekës individuale, e kombinuar me sekuencën me performancë të lartë, lejon studimet e shprehjes së gjeneve në bazë qelizë për qelizë.Ai mundëson një analizë më të thellë dhe të plotë të sistemit mbi popullatat komplekse të qelizave, në të cilat shmang kryesisht maskimin e heterogjenitetit të tyre duke marrë mesataren e të gjitha qelizave.
Megjithatë, disa qeliza nuk janë të përshtatshme për t'u shndërruar në suspension me një qelizë, kështu që nevojiten metoda të tjera të përgatitjes së mostrës - nxjerrja e bërthamës nga indet, domethënë, bërthama nxirret drejtpërdrejt nga indet ose qeliza dhe përgatitet në suspension me një bërthamë për një. renditja e qelizave.
BMK ofron shërbimin e sekuencës së ARN me një qelizë me bazë 10× Genomics ChromiumTM.Ky shërbim është përdorur gjerësisht në studime për studime të lidhura me sëmundjet, si diferencimi i qelizave imune, heterogjeniteti i tumorit, zhvillimi i indeve, etj.
Çipi i transkriptimit hapësinor: 10× Gjenomikë
Platforma: Platforma Illumina NovaSeq
-
Sekuenca e gjenomit të tërë bimëve/kafshëve
Risekuenca e të gjithë gjenomit, i njohur gjithashtu si WGS, mundëson zbulimin e mutacioneve të zakonshme dhe të rralla në të gjithë gjenomin, duke përfshirë Polimorfizmin Një Nukleotid (SNP), Fshirjen e Futjes (InDel), Variacionin e strukturës (SV) dhe Variacionin e Numrit të Kopjes (CNV). ).SV-të përbëjnë një pjesë më të madhe të bazës së variacionit sesa SNP-të dhe kanë një ndikim më të madh në gjenomin, i cili ka një efekt të rëndësishëm në organizmat e gjallë.Resekuenca e leximit të gjatë lejon identifikimin më të saktë të fragmenteve të mëdha dhe variacioneve të komplikuara, sepse leximet e gjata e bëjnë shumë më të lehtë kalimin e kromozomeve mbi rajone të ndërlikuara, si p.sh.
Platforma: Illumina, PacBio, Nanopore
-
BMKMANU S1000 Trankriptomi hapësinor
Organizimi hapësinor i qelizave luan një rol jetik në procese të ndryshme biologjike, si infiltrimi imunitar, zhvillimi i embrionit, etj. Sekuenca e transkriptomit hapësinor, e cila tregon profilizimin e shprehjes së gjeneve duke ruajtur informacionin e pozicionit hapësinor, ka ofruar njohuri të mëdha në arkitekturën e indeve në nivel transkriptomi.Me zhvillimin e teknologjisë, morfologjia ultra e qartë e indeve dhe ndryshimi real strukturor i shprehjes molekulare hapësinore duhet të studiohen me rezolucion më të lartë.BMKGENE ofron shërbim gjithëpërfshirës, me një ndalesë të sekuencës së transkriptimit hapësinor nga mostrat deri te njohuritë biologjike.
Teknologjitë e transkriptomikës hapësinore fuqizuan perspektiva të reja në arenë të ndryshme kërkimore duke zgjidhur profilin e shprehjes së gjeneve me përmbajtje hapësinore në mostrat heterogjene.
Çipi i transkriptimit hapësinor: BMKMANU S1000
Platforma: Platforma Illumina NovaSeq
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
Visium Spatial Gene Expression është një teknologji e zakonshme e sekuencës së transkriptomit hapësinor për klasifikimin e indeve bazuar në mARN totale.Harto të gjithë transkriptomin me kontekstin morfologjik për të zbuluar njohuri të reja mbi zhvillimin normal, patologjinë e sëmundjes dhe kërkimin klinik të përkthimit.BMKGENE ofron shërbim gjithëpërfshirës, me një ndalesë të sekuencës së transkriptimit hapësinor nga mostrat deri te njohuritë biologjike.
Teknologjitë e transkriptomikës hapësinore fuqizuan perspektiva të reja në arenë të ndryshme kërkimore duke zgjidhur profilin e shprehjes së gjeneve me përmbajtje hapësinore në mostrat heterogjene.
Çipi i transkriptimit hapësinor: 10x Genomics Visium
Platforma:Platforma Illumina NovaSeq
-
Sekuenca e mARN-së me gjatësi të plotë-Nanopore
Sekuenca e ARN-së ka qenë një mjet i paçmuar për analizën gjithëpërfshirëse të transkriptomës.Pa dyshim, sekuenca tradicionale e leximit të shkurtër arriti zhvillime të shumta të rëndësishme këtu.Sidoqoftë, ai shpesh has kufizime në identifikimin e izoformave me gjatësi të plotë, kuantifikimin, paragjykimin e PCR.
Sekuenca e nanoporeve dallohet nga platformat e tjera të sekuencës, në atë që nukleotidet lexohen drejtpërdrejt pa sintezën e ADN-së dhe gjenerojnë lexim të gjatë në dhjetëra kilobazë.Kjo fuqizon leximin e drejtpërdrejtë të kryqëzimit të transkripteve me gjatësi të plotë dhe trajtimin e sfidave në studimet e nivelit të izoformës.
Platforma：Nanopore PromethION
Librari:cDNA-PCR
-
Sekuenca e mRNA me gjatësi të plotë - PacBio
De novosekuenca e transkriptomës me gjatësi të plotë, e njohur edhe siDe novoIso-Seq merr avantazhet e sekuencuesit PacBio në gjatësinë e leximit, i cili mundëson renditjen e molekulave të cDNA me gjatësi të plotë pa asnjë ndërprerje.Kjo shmang plotësisht çdo gabim të krijuar në hapat e montimit të transkriptit dhe ndërton grupe unigene me rezolucion të nivelit të izoformës.Ky grup unigjen siguron informacion të fuqishëm gjenetik si "gjenom referues" në nivel transkriptomi.Përveç kësaj, duke u kombinuar me të dhënat e renditjes së gjeneratës së ardhshme, ky shërbim fuqizon një kuantifikimi të saktë të shprehjes së nivelit të izoformës.
Platforma: PacBio Sequel IIBiblioteka: biblioteka e ziles SMRT -
Sekuenca e mRNA eukariote-Illumina
Sekuenca e mARN-së mundëson profilizimin e të gjitha mARN-ve të transkriptuara nga qelizat në kushte specifike.Është një teknologji e fuqishme për zbulimin e profilit të shprehjes së gjeneve, strukturave gjenike dhe mekanizmave molekularë të disa proceseve biologjike.Deri më sot, sekuenca e mARN-së është përdorur gjerësisht në kërkimet themelore, diagnostikimin klinik, zhvillimin e ilaçeve, etj.
Platforma: Platforma Illumina NovaSeq
-
Sekuenca e mRNA-së jo-referencë-Illumina
Sekuenca e mARN-së miraton teknikën e sekuencës së gjeneratës së ardhshme (NGS) për të kapur ARN-në e dërguar (mRNA) nga Eukarioti në një periudhë specifike që aktivizojnë disa funksione të veçanta.Transkripti më i gjatë i bashkuar quhej 'Unigene' dhe u përdor si sekuencë referimi për analizat e mëvonshme, që është një mjet efektiv për të studiuar mekanizmin molekular dhe rrjetin rregullator të specieve pa referencë.
Pas grumbullimit të të dhënave të transkriptimit dhe shënimit funksional unigene
(1) Analiza SSR, parashikimi i CDS dhe struktura e gjeneve do të paraformohen.
(2) Do të kryhet sasia e shprehjes unigjene në çdo mostër.
(3) Unigjenet e shprehura në mënyrë diferenciale midis mostrave (ose grupeve) do të zbulohen në bazë të shprehjes unigjene
(4) Grumbullimi, shënimi funksional dhe analiza e pasurimit të unigjeneve të shprehura në mënyrë diferenciale do të kryhet
-
Sekuenca e gjatë jo-koduese-Illumina
ARN-të e gjata jo-koduese (lncARN) janë një lloj molekulash ARN me gjatësi më të madhe se 200 nt, të cilat karakterizohen nga një potencial kodues jashtëzakonisht i ulët.LncARN, si një anëtar kyç në ARN-të jo-koduese, gjendet kryesisht në bërthamë dhe plazmë.Zhvillimi në teknologjinë e sekuencës dhe bioinformtikës mundëson identifikimin e shumë lncARN-ve të reja dhe lidhjen e tyre me funksione biologjike.Dëshmitë akumuluese sugjerojnë se lncARN është e përfshirë gjerësisht në rregullimin epigjenetik, rregullimin e transkriptimit dhe rregullimin pas transkriptimit.
-
Sekuenca e vogël e ARN-së-Illumina
ARN e vogël i referohet një klase të molekulave të ARN-së jo-koduese që janë zakonisht më pak se 200 nt në gjatësi, duke përfshirë mikro ARN (miRNA), ARN me ndërhyrje të vogla (siRNA) dhe ARN ndërvepruese me piwi (piRNA).
MicroRNA (miRNA) është një klasë e ARN e vogël endogjene me një gjatësi prej rreth 20-24 nt, e cila luan një sërë rolesh të rëndësishme rregullatore në qeliza.miRNA është përfshirë në shumë procese jetësore të cilat zbulojnë indet - specifike dhe stade - shprehje specifike dhe janë shumë të ruajtura në specie të ndryshme.
-
sekuenca e circARN-së-Illumina
CircARN-të (ARN-të rrethore) janë një klasë e molekulave të ARN-së jo-koduese që nuk kanë kapak fundor 5' dhe bisht poli(A) fundor 3'.CircARN-të kryejnë strukturë rrethore nga lidhja kovalente e cila është status kundër tretjes së ARN-së ekzonukleazës.circARN luan një rol të rëndësishëm në rritjen dhe zhvillimin e organizmave dhe rezistencën e tyre ndaj mjedisit të jashtëm.
CircRNA ka shumë funksione, të cilat mund të lidhin në mënyrë konkurruese miRNA, të ushtrojnë funksionin rregullues të ceRNA, për të rregulluar shprehjen e gjeneve.Vitet e fundit është konstatuar gjithashtu se është i lidhur ngushtë me shfaqjen dhe zhvillimin e sëmundjeve dhe ka perspektiva të mëdha aplikimi në drejtim të shënuesve të diagnostikimit të sëmundjeve etj.
