条形 banner-03

Produktet

Sekuenca e mARN-së me gjatësi të plotë-Nanopore

Ndërsa sekuenca e mRNA me bazë NGS është një mjet i gjithanshëm për përcaktimin sasior të shprehjes së gjeneve, mbështetja e tij në leximet e shkurtra kufizon efikasitetin e tij në analizat komplekse transkriptomike. Nga ana tjetër, sekuenca e nanoporeve përdor teknologjinë e lexuar gjatë, duke mundësuar renditjen e transkripteve të mRNA me gjatësi të plotë. Kjo qasje lehtëson një eksplorim gjithëpërfshirës të bashkimit alternativ, shkrirjes së gjeneve, poliadenilimit dhe përcaktimit të sasisë së izoformave të mRNA.

Sekuenca e nanoporeve, një metodë që mbështetet në sinjalet elektrike në kohë reale me një molekulë nanopore, ofron rezultate në kohë reale. E udhëhequr nga proteinat motorike, ADN-ja me dy zinxhirë lidhet me proteinat nanopore të ngulitura në një biofilm, duke u zbërthyer ndërsa kalon nëpër kanalin nanopore nën një ndryshim tensioni. Sinjalet elektrike dalluese të gjeneruara nga baza të ndryshme në vargun e ADN-së zbulohen dhe klasifikohen në kohë reale, duke lehtësuar renditjen e saktë dhe të vazhdueshme të nukleotideve. Kjo qasje inovative kapërcen kufizimet e leximit të shkurtër dhe ofron një platformë dinamike për analiza të ndërlikuara gjenomike, duke përfshirë studime komplekse transkriptomike, me rezultate të menjëhershme.

Platforma: Nanopore PromethION 48


Detajet e Shërbimit

Bioinformatika

Rezultatet e demonstrimit

Publikime të zgjedhura

Veçoritë

● Kapja e mRNA-së poli-A e ndjekur nga sinteza e cADN-së dhe përgatitja e bibliotekës

● Renditja e transkripteve të plota

● Analiza bioinformatike e bazuar në përafrimin me një gjenom referues

● Analiza bioinformatike përfshin jo vetëm shprehjen në nivelin e gjeneve dhe të izoformës, por edhe analizën e ARN-së lnc, bashkimet e gjeneve, poliadenilimin dhe strukturën e gjeneve

Avantazhet e Shërbimit

Kuantifikimi i shprehjes në nivelin izoformë: mundëson analizën e detajuar dhe të saktë të shprehjes, zbulimin e ndryshimit që mund të maskohet kur analizohet e gjithë shprehja e gjenit

Kërkesa të reduktuara për të dhëna:Krahasuar me Sekuencën e Gjeneratës së ardhshme (NGS), sekuenca Nanopore shfaq kërkesa më të ulëta për të dhëna, duke lejuar nivele ekuivalente të ngopjes sasiore të shprehjes së gjeneve me të dhëna më të vogla.

Saktësia më e lartë e kuantifikimit të shprehjes: si në nivel gjenesh ashtu edhe në nivel izoformësh

Identifikimi i informacionit shtesë transkriptomik: poliadenilimi alternativ, gjenet e shkrirjes dhe lcnARN dhe gjenet e tyre të synuara

Ekspertizë e gjerë: Ekipi ynë sjell një përvojë të pasur për çdo projekt, pasi ka përfunduar mbi 850 projekte transkriptome me gjatësi të plotë Nanopore dhe ka përpunuar mbi 8,000 mostra.

Mbështetje pas shitjes: angazhimi ynë shtrihet përtej përfundimit të projektit me një periudhë shërbimi pas shitjes 3-mujore. Gjatë kësaj kohe, ne ofrojmë ndjekjen e projektit, ndihmë për zgjidhjen e problemeve dhe sesione pyetjesh dhe përgjigjesh për të adresuar çdo pyetje në lidhje me rezultatet.

Kërkesat e mostrës dhe dorëzimi

Biblioteka

Strategjia e renditjes

Të dhënat e rekomanduara

Kontrolli i cilësisë

Poli A i pasuruar

Ndriçues PE150

6/12 Gb

Nota mesatare e cilësisë: Q10

Kërkesat e mostrës:

Nukleotidet:

Konk.(ng/μl)

Sasia (μg)

Pastërti

Integriteti

≥ 100

≥ 1.0

OD260/280=1,7-2,5

OD260/230=0,5-2,5

Ndotje e kufizuar ose pa proteina ose ADN e treguar në xhel.

Për bimët: RIN≥7.0;

Për kafshët: RIN≥7.5;

5.0≥28S/18S≥1.0;

lartësi bazë e kufizuar ose aspak

● Bimët:

Rrënja, kërcelli ose petali: 450 mg

Gjethja ose fara: 300 mg

Fruta: 1.2 g

● Kafsha:

Zemra ose zorrë: 300 mg

Të brendshmet ose truri: 240 mg

Muskujt: 450 mg

Kockat, flokët ose lëkura: 1 g

● Artropodët:

Insektet: 6 g

Krustace: 300 mg

● Gjak i plotë: 1 tub

● Qelizat: 106 qelizat

Dorëzimi i mostrës së rekomanduar

Enë: tub centrifuge 2 ml (Folja e kallajit nuk rekomandohet)

Etiketimi i mostrës: Grup+përsëritje p.sh. A1, A2, A3; B1, B2, B3.

Dërgesa:

1. Akull i thatë: Mostrat duhet të paketohen në thasë dhe të varrosen në akull të thatë.

2. Tubat e qëndrueshëm me ARN: Mostrat e ARN-së mund të thahen në tubin e stabilizimit të ARN-së (p.sh. RNAstable®) dhe të dërgohen në temperaturën e dhomës.

Rrjedha e punës së shërbimit

Nukleotidet:

dorëzimi i mostrës

Dorëzimi i mostrës

Përgatitja e Bibliotekës

Ndërtimi i bibliotekës

Sekuenca

Sekuenca

Analiza e të dhënave

Analiza e të dhënave

Shërbimet pas shitjes

Shërbimet pas shitjes

Rrjedha e punës së shërbimit

Indi:

Shembull QC

Dizajni i eksperimentit

dorëzimi i mostrës

Dorëzimi i mostrës

Eksperiment pilot

Ekstraktimi i ARN-së

Përgatitja e Bibliotekës

Ndërtimi i bibliotekës

Sekuenca

Sekuenca

Analiza e të dhënave

Analiza e të dhënave

Shërbimet pas shitjes

Shërbimet pas shitjes


  • E mëparshme:
  • Tjetër:

  • me gjatësi të plotë

    ● Përpunimi i të dhënave të papërpunuara

    ● Identifikimi i transkriptit

    ● Ndarja alternative

    ● Kuantifikimi i shprehjes në nivelin e gjeneve dhe nivelin e izoformës

    ● Analiza e shprehjes diferenciale

    ● Shënimi dhe pasurimi i funksionit (DEG dhe DET)

     

    Analiza alternative e bashkimit图片 20 Analiza alternative e poliadenilimit (APA)

     

    图片21

     

    Parashikimi i lncARN

     图片22

     

    Shënimi i gjeneve të reja

     图片23

     

     

     Grumbullimi i DET-ve

     

     图片24

     

     

    Rrjetet proteina-proteinike në DEG

     

      图片25 

    Eksploroni përparimet e lehtësuara nga shërbimet e sekuencës së plotë të mRNA të Nanopore të BMKGene përmes një koleksioni të kuruar publikimesh.

     

    Gong, B. et al. (2023) 'Aktivizimi epigjenetik dhe transkriptues i kinazës sekretore FAM20C si një onkogjen në glioma', Journal of Genetics and Genomics, 50 (6), fq. 422-433. doi: 10.1016/J.JGG.2023.01.008.

    Ai, Z. et al. (2023) 'Sekuenca e transkriptomeve me gjatësi të plotë të limfociteve që i përgjigjen IFN-γ zbulon një përgjigje imune të shtrembëruar Th1 në llamba (Paralichthys olivaceus)', Fish & Shellfish Immunology, 134, f. 108636. doi: 10.1016/J.FSI.2023.108636.

    Ma, Y. et al. (2023) 'Analiza krahasuese e metodave të sekuencës së ARN-së PacBio dhe ONT për identifikimin e helmit të Nemopilema Nomurai', Genomics, 115 (6), f. 110709. doi: 10.1016/J.YGENO.2023.110709.

    Yu, D. et al. (2023) 'Analiza e Nano-seq zbulon tendencë të ndryshme funksionale midis ekzosomeve dhe mikrovezikulave që rrjedhin nga hUMSC', Kërkimi dhe terapia e qelizave staminale, 14 (1), fq. 1–13. doi: 10.1186/S13287-023-03491-5/TABLES/6.

     

    merrni një kuotë

    Shkruani mesazhin tuaj këtu dhe na dërgoni

    Na dërgoni mesazhin tuaj: