Sekuencat metatranscriptome
Karakteristikat e shërbimit
● RRNA e RRNA e ndjekur nga përgatitja e bibliotekës së mRNA të drejtimit.
● Sekuencimi në Illumina Novaseq.
Avantazhet e shërbimit
>Studioni ndryshimet e komuniteteve komplekse mikrobike:Kjo ndodh në nivelin transkriptues dhe eksploroni gjenet e reja të mundshme.
>Duke shpjeguar ndërveprimet e komunitetit mikrobik me hostin ose mjedisin.
>Analizë gjithëpërfshirëse bioinformatike: Kjo siguron njohuri mbi kompozimet taksonomike dhe funksionale të komunitetit, si dhe analizën e shprehjes së gjeneve diferenciale.
>Annotimi i gjerë i gjenit:Përdorimi i bazave të të dhënave të azhurnuara të funksionit të gjenit për informacionin informues të shprehjes së gjenit të komuniteteve mikrobike.
>Mbështetje pas shitjes:Angazhimi ynë shtrihet përtej përfundimit të projektit me një periudhë shërbimi pas shitjes 3-mujore. Gjatë kësaj kohe, ne ofrojmë ndjekjen e projektit, ndihmën e zgjidhjes së problemeve dhe seancat e Q&A për të adresuar çdo pyetje që lidhen me rezultatet.
Specifikimet e shërbimit
| Platformë e sekuencave | Strategjia e sekuencave | Të dhënat e rekomanduara | Kontrolli i cilësisë së të dhënave |
| Illumina Novaseq | PE150 | 12 GB | Q30≥85% |
Kërkesat e mostrës
| Përqendrimi (ng/μl) | Shuma totale (μg) | Vëllimi (μl) | OD260/280 | OD260/230 | Çift |
| ≥50 | ≥1.0 | ≥20 | 1.8-2.0 | 1.0-2.5 | ≥6.5 |
Rrjedha e punës së shërbimit
Dorëzimi i mostrës
Ndërtim bibliotekash
Sekuencim
Analiza e të dhënave
Shërbime pas shitjes
Përfshinë analizën e mëposhtme:
● Sekuencimi i kontrollit të cilësisë së të dhënave
● Asambleja e Transkriptit
Annotim Annotimi dhe bollëku taksonomik
Annotim Annotimi dhe bollëku funksional
● Sasia e shprehjes dhe analiza diferenciale
Shpërndarja taksonomike e secilit mostër:
Analiza e diversitetit beta: upgma
Shënimi funksional - shkoni me bollëk
Taksonomia Diferenciale Bollëku - Lefse
Eksploroni përparimet e lehtësuara nga shërbimet e sekuencave të transkriptomikës meta të BMKGene përmes një koleksioni të kuruar të botimeve.
Lu, Z. et al. (2023) 'Toleranca e acidit të baktereve që përdorin laktatin e rendit Bacteroidales kontribuon në parandalimin e acidozës ruminale në dhitë e përshtatura në një dietë me koncentrim të lartë',,Ushqim për kafshët, 14, faqe 130–140. doi: 10.1016/j.aninu.2023.05.006.
Kënga, Z. et al. (2017) 'Zbulimi i mikrobiotës funksionale thelbësore në fermentimin tradicional të gjendjes së ngurtë nga amplikonet me shpejtësi të lartë dhe sekuencat metatranscriptomics',,Kufijtë në mikrobiologji, 8 (korrik). doi: 10.3389/fmicb.2017.01294/e plotë.
Wang, W. et al. (2022) 'Mikoviruset e romanit të zbuluar nga një studim metatranscriptomics i kërpudhave fitopatogjene alternaria',Viruse, 14 (11), f. 2552. Doi: 10.3390/v14112552/s1.
Wei, J. et al. (2022) 'Analiza paralele metatranscriptome zbulon degradimin e metabolitëve sekondarë të bimëve nga beetles dhe simbolet e tyre të zorrëve',Molekular Ekologji, 31 (15), faqe 3999–4016. doi: 10.1111/Mec.16557.
