Sekuencimi i Metatranskriptomave
Karakteristikat e Shërbimit
● pakësimi i rRNA-së i ndjekur nga përgatitja e bibliotekës së mRNA-së të drejtuar.
● Sekuencimi në Illumina NovaSeq.
Avantazhet e Shërbimit
●Studioni ndryshimet e komuniteteve komplekse mikrobike:Kjo ndodh në nivelin transkriptues dhe eksploron gjenet e reja të mundshme.
●Shpjegimi i Ndërveprimeve të Komunitetit Mikrobial me Mikrobikun ose Mjedisin.
●Analizë Gjithëpërfshirëse BioinformatikeKjo ofron njohuri mbi përbërjet taksonomike dhe funksionale të komunitetit, si dhe analizën diferenciale të shprehjes së gjeneve.
●Shënim i gjerë i gjenit:Përdorimi i bazave të të dhënave të azhurnuara të funksionit të gjeneve për informacion informues mbi shprehjen e gjeneve të komuniteteve mikrobike.
●Mbështetje pas shitjes:Angazhimi ynë shtrihet përtej përfundimit të projektit me një periudhë shërbimi pas shitjes prej 3 muajsh. Gjatë kësaj kohe, ne ofrojmë ndjekje të projektit, ndihmë në zgjidhjen e problemeve dhe seanca pyetje-përgjigje për t'iu përgjigjur çdo pyetjeje që lidhet me rezultatet.
Specifikimet e Shërbimit
| Platforma e sekuencimit | Strategjia e Sekuencimit | Të dhëna të rekomanduara | Kontrolli i Cilësisë së të Dhënave |
| Illumina NovaSeq | PE150 | 12Gb | Q30≥85% |
Kërkesat e mostrës
| Përqendrimi (ng/µL) | Sasia totale (µg) | Vëllimi (µL) | OD260/280 | OD260/230 | RIN |
| ≥50 | ≥1.0 | ≥20 | 1.8-2.0 | 1.0-2.5 | ≥6.5 |
Fluksi i Punës së Shërbimit
Dorëzimi i mostrës
Ndërtimi i bibliotekës
Sekuencimi
Analiza e të dhënave
Shërbime pas shitjes
Përfshin analizën e mëposhtme:
● Kontrolli i Cilësisë së të Dhënave të Sekuencimit
● Asambleja e Transkriptit
● Shënim Taksonomik dhe Bollëk
● Shënim Funksional dhe Bollëk
● Kuantifikimi i Shprehjeve dhe Analiza Diferenciale
Shpërndarja taksonomike e secilës mostër:
Analiza e diversitetit Beta: UPGMA
Shënim funksional – bollëku i GO-së
Taksonomia diferenciale e bollëkut – LEFSE
Eksploroni përparimet e lehtësuara nga shërbimet e sekuencimit të meta-transkriptomikës të BMKGene përmes një koleksioni të kuruar botimesh.
Lu, Z. et al. (2023) 'Toleranca ndaj acidit e baktereve që përdorin laktat të rendit Bacteroidales kontribuon në parandalimin e acidozës ruminale te dhitë e adaptuara në një dietë me përqendrim të lartë',Ushqyerja e Kafshëve, 14, f. 130–140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.
Song, Z. et al. (2017) 'Zhbërthimi i mikrobiotës funksionale thelbësore në fermentimin tradicional në gjendje të ngurtë me anë të amplikoneve me rendiment të lartë dhe sekuencimit metatranskriptomik',Kufijtë në Mikrobiologji, 8 (KORRIK). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL.
Wang, W. et al. (2022) 'Mikoviruse të reja të zbuluara nga një studim metatranskriptomik i kërpudhës fitopatogjene Alternaria',Viruset, 14(11), f. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.
Wei, J. et al. (2022) 'Analiza paralele e metatranskriptomës zbulon degradimin e metabolitëve sekondarë të bimëve nga brumbujt dhe simbiontët e tyre të zorrëve',Molekulare Ekologji, 31 (15), f. 3999–4016. doi: 10.1111/MEC.16557.
