Sekuenca metatranskriptome
Karakteristikat e shërbimit
● Zbrazja e rARN-së e ndjekur nga përgatitja e bibliotekës së mRNA të drejtuar.
● Sekuenca në Illumina NovaSeq.
Avantazhet e Shërbimit
●Studioni ndryshimet e komuniteteve komplekse mikrobike:Kjo ndodh në nivelin e transkriptimit dhe eksploroni gjenet e reja të mundshme.
●Shpjegimi i ndërveprimeve të komunitetit mikrobial me pritësin ose mjedisin.
●Analizë Gjithëpërfshirëse Bioinformatike: Kjo ofron njohuri mbi përbërjet taksonomike dhe funksionale të komunitetit, si dhe analizën diferenciale të shprehjes së gjeneve.
●Shënim i gjerë i gjenit:Përdorimi i bazave të të dhënave të funksioneve të gjeneve të përditësuara për informacionin informativ të shprehjes së gjeneve të komuniteteve mikrobike.
●Mbështetje pas shitjes:Angazhimi ynë shtrihet përtej përfundimit të projektit me një periudhë shërbimi pas shitjes 3-mujore. Gjatë kësaj kohe, ne ofrojmë ndjekjen e projektit, ndihmë për zgjidhjen e problemeve dhe sesione pyetjesh dhe përgjigjesh për të adresuar çdo pyetje në lidhje me rezultatet.
Specifikimet e Shërbimit
| Platforma e renditjes | Strategjia e renditjes | Të dhënat e rekomanduara | Kontrolli i cilësisë së të dhënave |
| Illumina NovaSeq | PE150 | 12 Gb | Q30≥85% |
Kërkesat e mostrës
| Përqendrimi (ng/µL) | Sasia totale (μg) | Vëllimi (µL) | OD260/280 | OD260/230 | RIN |
| ≥50 | ≥1.0 | ≥20 | 1,8-2,0 | 1,0-2,5 | ≥6.5 |
Rrjedha e punës së shërbimit
Dorëzimi i mostrës
Ndërtimi i bibliotekës
Sekuenca
Analiza e të dhënave
Shërbimet pas shitjes
Përfshin analizën e mëposhtme:
● Kontrolli i cilësisë së të dhënave të renditjes
● Asambleja e transkriptit
● Shënimi taksonomik dhe bollëku
● Shënim funksional dhe bollëk
● Kuantifikimi i shprehjeve dhe analiza diferenciale
Shpërndarja taksonomike e çdo kampioni:
Analiza e diversitetit beta: UPGMA
Shënim funksional - GO bollëk
Bollëku i taksonomisë diferenciale – LEFSE
Eksploroni përparimet e lehtësuara nga shërbimet e renditjes së meta-transkriptomikës së BMKGene përmes një koleksioni të kuruar publikimesh.
Lu, Z. et al. (2023) 'Toleranca ndaj acideve ndaj baktereve që përdorin laktat të rendit Bacteroidales kontribuon në parandalimin e acidozës ruminale te dhitë e përshtatura me një dietë me koncentrat të lartë',Të ushqyerit e kafshëve, 14, f. 130–140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.
Song, Z. etj. (2017) "Zbulimi i mikrobiotës funksionale thelbësore në fermentimin tradicional të gjendjes së ngurtë me anë të amplikoneve me performancë të lartë dhe sekuencës metatranskriptomike",Kufijtë në Mikrobiologji, 8 (KORRIK). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL.
Wang, W. et al. (2022) 'Mikoviruset e reja të zbuluara nga një studim metatranskriptomik i kërpudhave fitopatogjene Alternaria',Viruset, 14 (11), f. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.
Wei, J. et al. (2022) 'Analiza paralele e metatranskriptomës zbulon degradimin e metabolitëve sekondarë të bimëve nga brumbujt dhe simbionet e tyre të zorrëve',molekulare Ekologjia, 31 (15), f. 3999–4016. doi: 10.1111/MEC.16557.
