条形баннер-03

Производи

Метагеномско секвенцирање -НГС

图片62

Метагеном је скуп укупног генетског материјала мешовите заједнице организама, као што су еколошки и људски метагеноми. Садржи геноме микроорганизама који се могу култивисати и који се не могу култивисати. Метагеномско секвенцирање пушке са НГС-ом омогућава проучавање ових сложених геномских пејзажа уграђених у узорке животне средине пружајући више од таксономског профилисања, дајући такође детаљан увид у разноликост врста, динамику обиља и сложене структуре становништва. Поред таксономских студија, метагеномика сачмарице такође нуди перспективу функционалне геномике, омогућавајући истраживање кодираних гена и њихове претпостављене улоге у еколошким процесима. Коначно, успостављање корелационих мрежа између генетских елемената и фактора животне средине доприноси холистичком разумевању замршене интеракције између микробних заједница и њихове еколошке позадине. У закључку, метагеномско секвенцирање представља кључни инструмент за откривање геномских замршености различитих микробних заједница, осветљавајући вишестране односе између генетике и екологије унутар ових сложених екосистема.

Платформе: Иллумина НоваСек и ДНБСЕК-Т7


Детаљи услуге

Биоинформатика

Демо Ресултс

Истакнуте публикације

Предности услуге

Метода без изолације и култивације за профилисање микробне заједнице: Омогућавање секвенцирања генетског материјала од некултурних организама.

Висока резолуција: Откријте врсте са малом заступљеношћу у узорцима животне средине.

Свеобухватна биоинформатичка анализа:Фокусиран не само на таксономску разноликост већ и на функционалну разноликост заједнице.

Велико искуство:Са евиденцијом успешног затварања више метагеномских пројеката у различитим истраживачким доменима и обрадом преко 200.000 узорака, наш тим доноси богато искуство у сваки пројекат.

Спецификације услуге

Платформа за секвенцирање

Стратегија секвенцирања

Подаци се препоручују

Контрола квалитета

Иллумина НоваСек или ДНБСЕК-Т7

ПЕ150

6-20Гб

К30≥85%

Сервице Рекуирементс

Концентрација (нг/µЛ)

Укупна количина (нг)

Запремина (µЛ)

≥1

≥30

≥20

● Земља/муљ: 2-3г
● Садржај црева-животиња: 0,5-2г
● Цревни садржај-инсект: 0,1-0,25г
● Површина биљке (обогаћени седимент): 0,5-1г
● Ферментациони бујон обогаћен талогом): 0,2-0,5г
● Измет (велике животиње): 0,5-2г
● Измет (миш): 3-5 зрна
● Течност за испирање плућне алвеоле: филтер папир
● Вагинални брис: 5-6 брисева
● Брис коже/гениталних органа/пљувачке/оралног меког ткива/брис ждрела/ректални брис: 2-3 бриса
● Површински микроорганизам: 5-6 брисева
● Водено тело/ваздух/биофилм: филтер папир
● Ендофити: 2-3 г
● Зубни плак: 0,5-1г

Ток рада услуге

достава узорка

Испорука узорка

Припрема библиотеке

Изградња библиотеке

Секвенцирање

Секвенцирање

Анализа података

Анализа података

Услуге након продаје

Услуге након продаје


  • Претходно:
  • Следеће:

  • 流程图 贝贝第三版-01

    Укључује следећу анализу:

    ● Контрола квалитета података секвенционирања

    ● Састављање метагенома и предвиђање гена

    ● Гене анотација

    ● Анализа таксономске алфа диверзитета

    ● Функционална анализа заједнице: биолошка функција, метаболичка, резистенција на антибиотике

    ● Анализа функционалне и таксономске разноликости:

    Бета анализа разноврсности

    Међугрупна анализа

    Анализа корелације: између фактора средине и састава и разноликости ОУТ

    Функционална анализа: ЦАРД резистенција на антибиотике

    图片63

    Диференцијална анализа КЕГГ метаболичких путева: топлотна мапа значајних путева

     

    图片64

     Алфа разноврсност таксономске дистрибуције: АЦЕ индекс

    图片65

     

    Бета разноврсност таксономске дистрибуције: ПЦоА

    图片66

    Истражите напредак који омогућава БМКГене-ове услуге секвенцирања метагенома са Иллумином кроз одабрану колекцију публикација.

    Хаи, К. ет ал. (2023) 'Метагеномска и метаболомска анализа промена у цревном садржају калифорнијске пастрмке (Онцорхинцхус микисс) инфициране вирусом инфективне хематопоетске некрозе при различитим температурама воде у култури',Границе у микробиологији, 14, стр. 1275649. дои: 10.3389/ФМИЦБ.2023.1275649.

    Мао, Ц. ет ал. (2023) 'Микробне заједнице, гени отпорности и ризици отпорности у урбаним језерима различитих трофичких стања: унутрашње везе и спољни утицаји',Јоурнал оф Хазардоус Материалс Адванцес, 9, стр. 100233. дои: 10.1016/Ј.ХАЗАДВ.2023.100233.

    Су, М. ет ал. (2022) 'Метагеномска анализа открила разлике у саставу и функцији између течно-повезаних и чврстих-повезаних микроорганизама овчијег румена',Границе у микробиологији, 13, стр. 851567. дои: 10.3389/ФМИЦБ.2022.851567.

    Иин, Ј. ет ал. (2023) „Микробиота гојазних свиња из Нингкианг-а обнавља метаболизам карнитина да би се подстакло таложење масних киселина у мишићима код мршавих ДЛИ свиња“,Тхе Инноватион, 4(5), стр. 100486. дои: 10.1016/Ј.КСИНН.2023.100486.

    Зхао, Кс. ет ал. (2023) „Метагеномски увиди у потенцијалне ризике репрезентативних био/неразградивих пластичних и непластичних остатака у горњем и доњем току ушћа Хаихе, Кина“,Наука о тоталној животној средини, 887, стр. 164026. дои: 10.1016/Ј.СЦИТОТЕНВ.2023.164026.

    добити понуду

    Напишите своју поруку овде и пошаљите нам је

    Пошаљите нам своју поруку: