-
Анализа асоцијација на нивоу генома
Студија асоцијација на нивоу генома (ГВАС) има за циљ идентификацију генетских варијанти (генотипа) које су повезане са специфичним особинама (фенотипом).ГВАС студија истражује генетске маркере који прелазе цео геном великог броја индивидуа и предвиђа повезаност генотип-фенотип статистичком анализом на нивоу популације.Има широку примену у истраживању људских болести и функционалном рударењу гена на сложеним особинама животиња или биљака.
-
Секвенцирање РНК са једним језгром
Напредак у хватању једне ћелије и техника изградње индивидуалне библиотеке у комбинацији са секвенционирањем високе пропусности омогућава студије експресије гена на бази ћелије по ћелију.Омогућава дубљу и потпунију системску анализу сложених ћелијских популација, у којој се у великој мери избегава маскирање њихове хетерогености узимајући просек свих ћелија.
Међутим, неке ћелије нису погодне за претварање у једноћелијску суспензију, па су потребне друге методе припреме узорака – екстракција језгра из ткива, односно, језгро се директно екстрахује из ткива или ћелије и припрема у једнонуклеусну суспензију за једноструке ћелије. секвенцирање ћелија.
БМК пружа 10× Геномицс ЦхромиумТМ услугу секвенцирања једноћелијске РНК.Ова услуга се широко користи у студијама о студијама везаним за болести, као што су диференцијација имуних ћелија, хетерогеност тумора, развој ткива итд.
Чип просторног транскриптома: 10× Геномика
Платформа: Иллумина НоваСек платформа
-
Секвенцирање целог генома биљке/животиње
Поновно секвенцирање целог генома, такође познато као ВГС, омогућава откривање уобичајених и ретких мутација на целом геному, укључујући полиморфизам једног нуклеотида (СНП), брисање уметања (ИнДел), варијацију структуре (СВ) и варијацију броја копија (ЦНВ). ).СВ чине већи део базе варијација од СНП-а и имају већи утицај на геном, што има значајан утицај на живе организме.Поновно секвенцирање дугог читања омогућава прецизнију идентификацију великих фрагмената и компликованих варијација јер дуга читања знатно олакшавају хромозомско укрштање преко компликованих региона као што су тандем понављања, региони богати ГЦ/АТ и хипер-варијабилни региони.
Платформа: Иллумина, ПацБио, Нанопоре
-
БМКМАНУ С1000 просторни транскрипт
Просторна организација ћелија игра виталну улогу у различитим биолошким процесима, као што су имунолошка инфилтрација, развој ембриона, итд. Секвенцирање просторног транскриптома, које указује на профилисање експресије гена уз задржавање информација о просторном положају, пружа сјајан увид у архитектуру ткива на нивоу транскриптома.Са развојем технологије, ултра-јасну морфологију ткива и стварну структурну разлику просторне молекуларне експресије потребно је проучавати са вишом резолуцијом.БМКГЕНЕ пружа свеобухватну услугу секвенцирања просторних транскриптома на једном месту од узорака до биолошких увида.
Технологије просторне транскриптомике омогућиле су нове перспективе у различитим истраживачким аренама решавањем профила експресије гена са просторним садржајем у хетерогеним узорцима.
Чип просторног транскрипта: БМКМАНУ С1000
Платформа: Иллумина НоваСек платформа
-
10к Геномицс Висиум просторни транскрипт
Висиум просторна експресија гена је главна технологија секвенцирања просторног транскриптома за класификацију ткива на основу укупне мРНК.Мапирајте цео транскриптом са морфолошким контекстом да бисте открили нове увиде у нормалан развој, патологију болести и клиничка транслациона истраживања.БМКГЕНЕ пружа свеобухватну услугу секвенцирања просторних транскриптома на једном месту од узорака до биолошких увида.
Технологије просторне транскриптомике омогућиле су нове перспективе у различитим истраживачким аренама решавањем профила експресије гена са просторним садржајем у хетерогеним узорцима.
Чип просторног транскриптома: 10к Геномицс Висиум
Платформа:Иллумина НоваСек платформа
-
Секвенцирање мРНА пуне дужине-Нанопоре
РНК секвенцирање је било непроцењиво средство за свеобухватну анализу транскриптома.Несумњиво је да је традиционално секвенцирање кратког читања овде постигло бројне важне помаке.Ипак, често наилази на ограничења у идентификацији изоформе пуне дужине, квантификацији, ПЦР пристрасности.
Секвенцирање нанопора се разликује од других платформи за секвенцирање по томе што се нуклеотиди читају директно без синтезе ДНК и генерише дуго читање на десетинама килобаза.Ово омогућава директно читање укрштањем транскрипата пуне дужине и суочавање са изазовима у студијама на нивоу изоформе.
Платформа:Нанопоре ПрометхИОН
библиотека:цДНА-ПЦР
-
Секвенцирање мРНА пуне дужине -ПацБио
Де новосеквенцирање транскриптома пуне дужине, такође познато каоДе новоИсо-Сек користи предности ПацБио секвенцера у дужини читања, што омогућава секвенцирање цДНК молекула пуне дужине без икаквих прекида.Ово у потпуности избегава све грешке настале у корацима састављања транскрипта и конструише унигене скупове са резолуцијом на нивоу изоформе.Овај унигенски сет пружа моћне генетске информације као „референтни геном“ на нивоу транскриптома.Поред тога, у комбинацији са подацима секвенцирања следеће генерације, ова услуга омогућава тачну квантификацију експресије на нивоу изоформе.
Платформа: ПацБио Секуел ИИБиблиотека: СМРТ библиотека звона -
Еукариотска мРНА Секуенцинг-Иллумина
Секвенцирање мРНК омогућава профилисање свих мРНК транскриптованих из ћелија под специфичним условима.То је моћна технологија за откривање профила генске експресије, генских структура и молекуларних механизама одређених биолошких процеса.До данас, секвенцирање мРНА је широко коришћено у фундаменталним истраживањима, клиничкој дијагностици, развоју лекова итд.
Платформа: Иллумина НоваСек платформа
-
Нереферентно засновано мРНА секвенцирање-Иллумина
Секвенцирање мРНК усваја технику секвенцирања следеће генерације (НГС) за хватање гласничке РНК (мРНК) из еукариота у одређеном периоду када се неке посебне функције активирају.Најдужи транскрипт спојен је назван 'Унигене' и коришћен је као референтна секвенца за накнадну анализу, што је ефикасно средство за проучавање молекуларног механизма и регулаторне мреже врсте без референце.
Након састављања података транскриптома и унигене функционалне анотације
(1) ССР анализа, ЦДС предвиђање и структура гена ће бити припремљени.
(2) Извршиће се квантификација експресије унигена у сваком узорку.
(3) Диференцијално изражени унигени између узорака (или група) биће откривени на основу унигене експресије
(4) Радиће се груписање, функционална анотација и анализа обогаћивања различито изражених унигена
-
Дуго некодирајуће секвенцирање-Иллумина
Дуге некодирајуће РНК (лнцРНА) су тип молекула РНК дужине преко 200 нт, које карактерише изузетно низак потенцијал кодирања.ЛнцРНА, као кључни члан некодирајућих РНК, углавном се налази у језгру и плазми.Развој технологије секвенцирања и биоинформтике омогућава идентификацију бројних нових лнцРНА и њихово повезивање са биолошким функцијама.Акумулативни докази сугеришу да је лнцРНА широко укључена у епигенетску регулацију, регулацију транскрипције и пост-транскрипциону регулацију.
-
Мала РНК секвенцирање-Иллумина
Мала РНК се односи на класу некодирајућих РНК молекула који су обично краћи од 200 нт у дужини, укључујући микро РНК (миРНА), малу интерферентну РНК (сиРНА) и РНК у интеракцији са пиви (пиРНА).
МикроРНА (миРНА) је класа ендогене мале РНК дужине од око 20-24нт, која игра различите важне регулаторне улоге у ћелијама.миРНА је укључена у многе животне процесе који откривају ткиво – специфичну и стадијумску – специфичну експресију и високо очувану код различитих врста.
-
секвенцирање цирцРНА-Иллумина
ЦирцРНА (кружне РНК) су једна класа некодирајућих РНК молекула којима недостаје 5′ завршна капа и 3′ крај поли(А) реп.ЦирцРНА имају кружну структуру ковалентном везом која је статус против варења РНК егзонуклеазе.цирцРНА игра важну улогу у расту и развоју организама и њиховој отпорности на спољашњу средину.
ЦирцРНА има много функција, које могу компетитивно да вежу миРНА, врше регулаторну функцију цеРНА, да регулишу експресију гена.Последњих година је такође утврђено да је уско повезан са појавом и развојем болести, и да има велике изгледе за примену у правцу маркера дијагнозе болести и сл.
