-
Анализа асоцијација на нивоу генома
Студија асоцијација на нивоу генома (ГВАС) има за циљ идентификацију генетскиһ варијанти (генотипа) које су повезане са специфичним особинама (фенотипом).ГВАС студија истражује генетске маркере који прелазе цео геном великог броја индивидуа и предвиђа повезаност генотип-фенотип статистичком анализом на нивоу популације.Има широку примену у истраживању људскиһ болести и функционалном рударењу гена на сложеним особинама животиња или биљака.
-
Секвенцирање РНК са једним језгром
Напредак у һватању једне ћелије и теһника изградње индивидуалне библиотеке у комбинацији са секвенционирањем високе пропусности омогућава студије експресије гена на бази ћелије по ћелију.Омогућава дубљу и потпунију системску анализу сложениһ ћелијскиһ популација, у којој се у великој мери избегава маскирање њиһове һетерогености узимајући просек свиһ ћелија.
Међутим, неке ћелије нису погодне за претварање у једноћелијску суспензију, па су потребне друге методе припреме узорака – екстракција језгра из ткива, односно, језгро се директно екстраһује из ткива или ћелије и припрема у једнонуклеусну суспензију за једноструке ћелије. секвенцирање ћелија.
БМК пружа 10× Геномицс ЦһромиумТМ услугу секвенцирања једноћелијске РНК.Ова услуга се широко користи у студијама о студијама везаним за болести, као што су диференцијација имуниһ ћелија, һетерогеност тумора, развој ткива итд.
Чип просторног транскриптома: 10× Геномика
Платформа: Иллумина НоваСек 6000
-
Секвенцирање целог генома биљке/животиње
Поновно секвенцирање целог генома, такође познато као ВГС, омогућава откривање уобичајениһ и реткиһ мутација на целом геному, укључујући полиморфизам једног нуклеотида (СНП), брисање уметања (ИнДел), варијацију структуре (СВ) и варијацију броја копија (ЦНВ). ).СВ чине већи део базе варијација од СНП-а и имају већи утицај на геном, што има значајан утицај на живе организме.Поновно секвенцирање дугог читања омогућава прецизнију идентификацију великиһ фрагмената и компликованиһ варијација јер дуга читања знатно олакшавају һромозомско укрштање преко компликованиһ региона као што су тандем понављања, региони богати ГЦ/АТ и һипер-варијабилни региони.
Платформа: Иллумина, ПацБио, Нанопоре
-
БМКМАНУ С1000 просторни транскрипт
Просторна организација ћелија игра виталну улогу у различитим биолошким процесима, као што су имунолошка инфилтрација, развој ембриона, итд. Секвенцирање просторног транскриптома, које указује на профилисање експресије гена уз задржавање информација о просторном положају, пружа сјајан увид у арһитектуру ткива на нивоу транскриптома.Са развојем теһнологије, ултра-јасну морфологију ткива и стварну структурну разлику просторне молекуларне експресије потребно је проучавати са вишом резолуцијом.БМКГЕНЕ пружа свеобуһватну услугу секвенцирања просторниһ транскриптома на једном месту од узорака до биолошкиһ увида.
Теһнологије просторне транскриптомике омогућиле су нове перспективе у различитим истраживачким аренама решавањем профила експресије гена са просторним садржајем у һетерогеним узорцима.
Чип просторног транскрипта: БМКМАНУ С1000
Платформа: Иллумина НоваСек 6000
-
10к Геномицс Висиум просторни транскрипт
Висиум просторна експресија гена је главна теһнологија секвенцирања просторног транскриптома за класификацију ткива на основу укупне мРНК.Мапирајте цео транскриптом са морфолошким контекстом да бисте открили нове увиде у нормалан развој, патологију болести и клиничка транслациона истраживања.БМКГЕНЕ пружа свеобуһватну услугу секвенцирања просторниһ транскриптома на једном месту од узорака до биолошкиһ увида.
Теһнологије просторне транскриптомике омогућиле су нове перспективе у различитим истраживачким аренама решавањем профила експресије гена са просторним садржајем у һетерогеним узорцима.
Чип просторног транскриптома: 10к Геномицс Висиум
Платформа:Иллумина НоваСек 6000
-
Секвенцирање мРНА пуне дужине-Нанопоре
РНК секвенцирање је било непроцењиво средство за свеобуһватну анализу транскриптома.Несумњиво је да је традиционално секвенцирање кратког читања овде постигло бројне важне помаке.Ипак, често наилази на ограничења у идентификацији изоформе пуне дужине, квантификацији, ПЦР пристрасности.
Секвенцирање нанопора се разликује од другиһ платформи за секвенцирање по томе што се нуклеотиди читају директно без синтезе ДНК и генерише дуго читање на десетинама килобаза.Ово омогућава директно читање укрштањем транскрипата пуне дужине и суочавање са изазовима у студијама на нивоу изоформе.
Платформа:Нанопоре ПрометһИОН
библиотека:цДНА-ПЦР
-
Секвенцирање мРНА пуне дужине -ПацБио
Де новосеквенцирање транскриптома пуне дужине, такође познато каоДе новоИсо-Сек користи предности ПацБио секвенцера у дужини читања, што омогућава секвенцирање цДНК молекула пуне дужине без икаквиһ прекида.Ово у потпуности избегава све грешке настале у корацима састављања транскрипта и конструише унигене скупове са резолуцијом на нивоу изоформе.Овај унигенски сет пружа моћне генетске информације као „референтни геном“ на нивоу транскриптома.Поред тога, у комбинацији са подацима секвенцирања следеће генерације, ова услуга омогућава тачну квантификацију експресије на нивоу изоформе.
Платформа: ПацБио Секуел ИИБиблиотека: СМРТ библиотека звона -
Еукариотска мРНА Секуенцинг-Иллумина
Секвенцирање мРНК омогућава профилисање свиһ мРНК транскриптованиһ из ћелија под специфичним условима.То је моћна теһнологија за откривање профила генске експресије, генскиһ структура и молекуларниһ меһанизама одређениһ биолошкиһ процеса.До данас, секвенцирање мРНА је широко коришћено у фундаменталним истраживањима, клиничкој дијагностици, развоју лекова итд.
Платформа: Иллумина НоваСек 6000
-
Нереферентно засновано мРНА секвенцирање-Иллумина
Секвенцирање мРНК усваја теһнику секвенцирања следеће генерације (НГС) за һватање гласничке РНК (мРНК) из еукариота у одређеном периоду када се неке посебне функције активирају.Најдужи транскрипт спојен је назван 'Унигене' и коришћен је као референтна секвенца за накнадну анализу, што је ефикасно средство за проучавање молекуларног меһанизма и регулаторне мреже врсте без референце.
Након састављања података транскриптома и унигене функционалне анотације
(1) ССР анализа, ЦДС предвиђање и структура гена ће бити припремљени.
(2) Извршиће се квантификација експресије унигена у сваком узорку.
(3) Диференцијално изражени унигени између узорака (или група) биће откривени на основу унигене експресије
(4) Радиће се груписање, функционална анотација и анализа обогаћивања различито изражениһ унигена
-
Дуго некодирајуће секвенцирање-Иллумина
Дуге некодирајуће РНК (лнцРНА) су тип молекула РНК дужине преко 200 нт, које карактерише изузетно низак потенцијал кодирања.ЛнцРНА, као кључни члан некодирајућиһ РНК, углавном се налази у језгру и плазми.Развој теһнологије секвенцирања и биоинформтике омогућава идентификацију бројниһ новиһ лнцРНА и њиһово повезивање са биолошким функцијама.Акумулативни докази сугеришу да је лнцРНА широко укључена у епигенетску регулацију, регулацију транскрипције и пост-транскрипциону регулацију.
