היץ־מאַפּע
דער היץ-מאַפּ געצייַג אַקסעפּטירט אַ מאַטריץ דאַטן טעקע ווי אַרייַנשרייַב און אַלאַוז ניצערס צו פילטערן, נאָרמאַליזירן און קלאַסטער דאַטן. דער הויפּט נוצן פאַל פֿאַר היץ-מאַפּס איז קלאַסטער אַנאַליסיס פון דזשין אויסדרוק מדרגה צווישן פאַרשידענע סאַמפּאַלז.
גענע אַנאָטאַציע
דער גענע אנאטאציע געצייג פירט אויס גענע אנאטאציע באזירט אויף סיקווענס אויסגלייכונג פון אינפוט FASTA טעקעס קעגן פארשידענע דאטאבאזעס.
גרונטלעכע לאקאלע אויסלייג זוכ-געצייג (BLAST)
דער BLAST געצייַג איז אַן BMKCloud אינטעגרירטע ווערסיע פון NCBI BLAST און קען געניצט ווערן צו דורכפירן די זעלבע פונקציעס ניצנדיק דאַטן וואָס זענען אַרויפגעלאָדן געוואָרן צום BMKCloud חשבון.
CDS_UTR פאָרויסזאָגן
די CDS_UTR פּרעדיקציע געצייַג איז דיזיינד צו פאָרויסזאָגן קאָדירונג געגנטן (CDS) און ניט-קאָדירונג געגנטן (UTR) אין געגעבענע טראַנסקריפּט סיקוואַנסן באַזירט אויף BLAST רעזולטאַטן קעגן באַקאַנטע פּראָטעין דאַטאַבייסעס און ORF פּרעדיקציע רעזולטאַטן.
מאַנהעטן פּלאַנעווען
דער מאַנהעטן פּלאָט געצייַג ערמעגליכט די ווייַזונג פון הויך מוסטער עקספּערימענטן און ווערט אָפט געניצט אין גענאָם-ברייט אַסאָציאַציע שטודיעס (GWAS).
סירקאָס דיאַגראַם
דער CIRCOS דיאַגראַם געצייַג גיט עפעקטיווע וויזואַליזאַציע פון ווי גענאָמישע פֿעיִקייטן זענען פאַרשפּרייט איבערן גענאָם. געוויינטלעכע פֿעיִקייטן אַרייַננעמען קוואַנטיטאַטיווע לאָסי, SNPs, InDels, סטרוקטורעלע און קאָפּיע נומער וואַריאַנטן.
גענע אָנטאָלאָגיע (GO) באַרייַכערונג
דאס GO ענריטשמענט געצייג גיט פונקציאָנעלע ענריטשמענט אנאליז. די הויפּט ווייכווארג אין דעם געצייג איז די TopGO-Bioconductor פּעקל, וואָס כולל דיפערענציעלע אויסדרוק אנאליז, GO ענריטשמענט אנאליז און וויזואַליזאַציע פון די רעזולטאַטן.
געוויכטעטע גענע קא-עקספרעסיע נעטוואָרק אנאליז (WGCNA)
WGCNA איז אַ ברייט גענוצטע דאַטן מיינינג מעטאָדע פֿאַר אַנטדעקן גענע קאָ-עקספּרעסיע מאָדולן. עס איז אָנווענדלעך צו פֿאַרשידענע עקספּרעסיע דאַטאַסעט אַרייַנגערעכנט מיקראָאַרריי און NGS גענע עקספּרעסיע דאַטן.
אינטערפּראָסקאַן
דער אינטערפּראָסקען געצייַג צושטעלט אינטערפּראָ פּראָטעין סיקוואַנס אַנאַליז און קלאַסיפֿיקאַציע.
GO KEGG ענריטשמענט
דער GO KEGG ענריטשמענט טול איז דיזיינט צו דזשענערירן אַ GO ענריטשמענט היסטאָגראַם, KEGG ענריטשמענט היסטאָגראַם און KEGG ענריטשמענט פּאַטוויי באַזירט אויף אַ צוגעשטעלטן גען סעט און קאָרעספּאָנדירנדיק אַנאָטאַציע.
