حرارت کا نقشہ
میٹرکس ڈیٹا فائل کو ہیٹ میپ ڈرائنگ کے لیے استعمال کیا جاتا ہے، جو میٹرکس ڈیٹا کو فلٹر، نارملائز اور کلسٹر کر سکتی ہے۔یہ زیادہ تر مختلف نمونوں کے درمیان جین کے اظہار کی سطح کے کلسٹر تجزیہ کے لیے استعمال ہوتا ہے۔
جین تشریح
جین فنکشن تشریح مختلف ڈیٹا بیس کے خلاف فاسٹا فائل میں ترتیب کی نقشہ سازی کے ذریعے کی جاتی ہے۔
جین تشریح
بنیادی مقامی سیدھ تلاش کا آلہ
CDS_UTR_پیش گوئی
یہ ٹول کوڈنگ ریجنز (CDS) اور نان کوڈنگ ریجنز (UTR) کی پیشین گوئی کرنے کے لیے ڈیزائن کیا گیا ہے تاکہ معلوم پروٹین ڈیٹا بیس اور ORF کی پیشن گوئی کے خلاف بلاسٹنگ کی بنیاد پر دیے گئے ٹرانسکرپٹ سیکوینسز میں۔
مین ہٹن پلاٹ
مین ہٹن پلاٹ ڈیٹا پوائنٹس کی ایک بڑی تعداد کے ساتھ ڈیٹا کی نمائش کو قابل بناتا ہے۔یہ عام طور پر جینوم وائیڈ ایسوسی ایشن اسٹڈیز (GWAS) میں استعمال ہوتا ہے۔
سرکوس
CIRCOS ڈایاگرام جینوم پر SNP، InDeL، SV، CNV تقسیم کی براہ راست پیشکش کو قابل بناتا ہے۔
GO_Enrichment
TopGO ایک ٹول ہے جسے فنکشنل افزودگی کے لیے ڈیزائن کیا گیا ہے۔TopGO-Bioconductor پیکیج میں تفریق اظہار تجزیہ، GO افزودگی کا تجزیہ اور نتائج کا تصور شامل ہے۔یہ "Graph" نامی آؤٹ پٹ کے ساتھ ایک فولڈر تیار کرے گا، جس میں topGO_BP، topGO_CC اور topGO_MF کے نتائج ہوں گے۔
ڈبلیو جی سی این اے
WGCNA ایک وسیع پیمانے پر استعمال ہونے والا ڈیٹا مائننگ طریقہ ہے جو جین کو-اظہار کے ماڈیولز کو دریافت کرنے کے لیے ہے۔یہ مختلف ایکسپریشن ڈیٹاسیٹ پر لاگو ہوتا ہے بشمول مائکرو رے ڈیٹا اور جین ایکسپریشن ڈیٹا جو اگلی نسل کی ترتیب سے پیدا ہوتا ہے۔
انٹر پرو اسکین
انٹر پرو پروٹین کی ترتیب کا تجزیہ اور درجہ بندی
GO_KEGG_Enrichment
یہ ٹول GO افزودگی ہسٹوگرام، KEGG افزودگی ہسٹوگرام اور KEGG افزودگی کا راستہ فراہم کرنے والے جین سیٹ اور متعلقہ تشریح کی بنیاد پر تیار کرنے کے لیے ڈیزائن کیا گیا ہے۔