DNA / RNA Sequencing - Nanopore Sequencer

ONT Sequencing ass eng eenzeg Molekül Echtzäit elektresch Signal Sequencing Technologie baséiert op Nanoporen, de Sequenzéierungsprinzip vun all Plattform ass d'selwecht.Duebelstrengend DNA / RNA bindt sech un nanoporös Protein agebaut am Biofilm an entspant sech ënner der Leedung vum Motorprotein, ënner der Handlung vum Spannungsdifferenz vu béide Säiten vum Biofilm, passéieren DNA / RNA Strécke duerch den Nanopore Kanalprotein op enger bestëmmter Zäit. Taux.Wéinst den Ënnerscheeder vun de chemeschen Eegeschafte vun de verschiddene Basen op der DNA / RNA Strang, wann eng eenzeg Basis oder DNA Molekül duerch den Nanopore Kanal passéiert, verursaacht et d'Verännerung vu verschiddenen elektresche Signaler.Andeems Dir dës Signaler erkennt an entsprécht, kënnen déi entspriechend Basistypen berechent ginn, an d'Echtzäiterkennung vun der Sequenz kann ofgeschloss ginn.

Kontaktéiert eis

Service Detailer

Demo Resultat

Service Detailer Fonctiounen

Plattform	Bibliothéik Gréisst	Theoretesch Datenausbezuelung (Per Zell)	Single-Basis Genauegkeet	Uwendungen
Nanopore	8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR	70-90 Gb/Zell	85-92%	SV Calling, De novo, Volllängt Sequenzéierung, Iso-Seq, Gen Annotatioun, Detektioun vun DNA Methylatioun

Service Virdeeler

● Iwwer 5 Joer Erfahrung op PacBio Sequenzéierungsplattform mat Dausende vu geschlossene Projete mat verschiddenen Arten.
● BMKGENE ass en offiziellen Partner vun Oxford Nanopore, mat Dual Plattform RNA / DNA Zertifizéierung.
● Et gi Mainstream Modeller vu Sequenzer mat kompletten Ausrüstung a genuch Sequenzéierungsduerchgang.
● Baséierend op der Nanopore Plattform sinn méi wéi 10 Déieren- a Planz Denovo Fuerschungen an international renomméierten Zäitschrëften publizéiert ginn.

Prouf Ufuerderunge

Beispill Typ

Betrag

Konzentratioun (Qubit®)

Volumen

Rengheet

Anerer

Genomesch DNA

Hänkt vun Daten Ufuerderung

≥20 ng/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1.5;

Kloer Peak bei 260 nm, keng Kontaminatioune

D'Konzentratioun muss duerch Qubit a Qubit/Nanopore ≤ 2 gemooss ginn

Total RNA

≥ 1,2 μg

≥100 μg/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5; keng Kontaminatioune

RIN Wäert ≥7,5

Service Workflow

Probe Virbereedung

Bibliothéik Bau

Sequenzéieren

Donnéeën Analyse

Projet Liwwerung

virdrun: DNA / RNA Sequencing - Illumina Sequencer

Nächste: Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF-Seq)

Datequalitéit Bewäertung vun DNA Sample

Dësch 1. Statistiken op propper Donnéeën.

BMKID	rawSeqNum	rawSumBase	cleanSeqNum	cleanSumBase	propperN50Len	propperN90Len	cleanMeanLen	propperMaxLen	cleanMeanQual
DNA_BMK01	1.218.239	26.37	1.121.736	25,90	28,014	15.764	23.090	143,181	9