BMKCloud Umellen

Produkter

DNA/RNA-Sequenzéierung – Nanopore-Sequencer

ONT-Sequenzéierung ass eng Echtzäit-Sequenzéierungstechnologie fir elektresch Signaler mat eenzelne Molekülen, déi op Nanopore baséiert ass. De Sequenzéierungsprinzip vun all Plattform ass dee selwechten. Duebelstrangeg DNA/RNA bindt sech un en nanoporöst Protein, dat am Biofilm agebett ass a sech ënner der Leedung vun engem Motorprotein ofwéckelt. Ënner der Aktioun vun engem Spannungsënnerscheed op béide Säite vum Biofilm passéieren d'DNA/RNA-Sträng mat enger bestëmmter Geschwindegkeet duerch de Protein am Nanoporekanal. Wéinst den Ënnerscheeder an de chemeschen Eegeschafte vun de verschiddene Basen um DNA/RNA-Sträng, verursaacht eng eenzeg Basis oder DNA-Molekül duerch den Nanoporekanal eng Ännerung vun de verschiddenen elektresche Signaler. Duerch d'Detektioun an d'Korrespondenz vun dëse Signaler kënnen déi entspriechend Basentypen berechent ginn, an d'Echtzäitdetektioun vun der Sequenz kann ofgeschloss ginn.

Kontaktéiert eis

Service Detailer

Demo-Resultat

Service Detailer Funktiounen

Plattform	Gréisst vun der Bibliothéik	Theoretesch Datenausbezuelung (pro Zell)	Genauegkeet vun enger Basis	Uwendungen
Nanopore	8Kb, 10kb, 20kb, Ultralaang, cDNA-PCR	70-90Gb/Handy	85-92%	SV-Uruff, De novo, Volllängt-Sequenzéierung, Iso-Seq, Genannotatioun, Detektioun vun DNA-Methylierung

Virdeeler vum Service

● Iwwer 5 Joer Erfahrung op der PacBio Sequenzéierungsplattform mat Dausende vu geschlossene Projeten mat verschiddenen Aarten.
● BMKGENE ass en offiziellen Partner vun Oxford Nanopore, mat enger RNA/DNA-Zertifizéierung op zwou Plattformen.
● Et gëtt Mainstream-Modeller vu Sequenzer mat kompletter Ausrüstung an engem ausreechende Sequenzéierungsduerchgank.
● Baséierend op der Nanopore Plattform goufen iwwer 10 Déier- a Planzefuerschungsstudien vun Denovo an international renomméierte Zäitschrëften publizéiert.

Ufuerderunge fir d'Beispill

Prouftyp

Betrag

Konzentratioun (Qubit ®)

Volumen

Rengheet

Anerer

Genomesch DNA

Ofhängeg vun den Datenufuerderungen

≥20 ng/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1.5;

Kloer Peak bei 260 nm, keng Kontaminatiounen

D'Konzentratioun muss mat Qubit gemooss ginn a Qubit/Nanopore ≤ 2

Gesamt-RNA

≥1,2 μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5; keng Kontaminatiounen

RIN-Wäert ≥7,5

Service-Aarbechtsfloss

Virbereedung vun der Prouf

Bau vun der Bibliothéik

Sequenzéierung

Datenanalyse

Projetliwwerung

Virdrun: Illumina virgemaachte Bibliothéiken

Weider: Spezifesch-Lokus-amplifizéiert Fragmentsequenzéierung (SLAF-Seq)

Bewäertung vun der Datenqualitéit vun der DNA-Prouf

Tabelle 1. Statistiken iwwer propper Donnéeën.

BMKID	rawSeqNum	rawSumBasis	cleanSeqNum	cleanSumBase	propperN50Len	propperN90Len	cleanMeanLen	cleanMaxLen	cleanMeanQual
DNA_BMK01	1.218.239	26,37	1.121.736	25,90	28.014	15.764	23.090	143.181	9

Bewäertung vun der Datenqualitéit vun der RNA-Prouf

Tabelle 1. Statistiken iwwer propper Donnéeën.

Dateinumm	Client-ID	Liesnummer	Basisnummer	N50	Duerchschnëttslängt	Maximal Längt	Duerchschnëttleche Qscore
RNA_BMK001	C2	8.947.708	4.047.230.083	398	452	129.227	Q12