Analysis Associationis Totius Genomatis
Ordo Operis
Commoda Servitii
●Peritia Ampla et Acta PublicationumCum experientia in GWAS accumulata, BMKGene centenas proiecta specierum in investigatione GWAS populationum perfecit, investigatores adiuvit ut plus quam centum articulos ederent, et factor impactus cumulativus 500 attigit.
● Analysis bioinformatica comprehensivaModus operandi analysin associationis SNP et proprietatum comprehendit, seriem genorum candidatorum et annotationem functionalem correspondentem praebens.
●Turma bioinformatica peritissima et cyclus analysis brevisMagna experientia in analysi genomica provecta, turma BMKGene analyses comprehensivas celeriter praebet.
●Auxilium Post-Venditionis:Nostra obligatio ultra completionem operis extenditur, cum spatio trium mensium servitii post-venditionis. Per hoc tempus, subsequentia operis, auxilium in remediis difficultatum, et sessiones interrogationum et responsionum offerimus ad quaslibet quaestiones de eventibus tractandas.
Specificationes et requisita servitii
| Genus sequentiationis | Scala populationis commendata | Strategia Sequentiationis | Requisita nucleotidorum |
| Sequentiatio Genomatis Totius | Ducenta exempla | Decies | Concentratio: ≥ 1 ng/ µL Summa totalis ≥ 30ng Degradatio vel contaminatio limitata vel nulla |
| Fragmentum Amplificatum Loci Specifici (SLAF) | Profunditas notae: 10x Numerus inscriptionum: < 400 Mb: WGS commendatur < 1Gb: 100K notae 1Gb > 2Gb: 300K notae Maxime 500 milia inscriptionum | Concentratio ≥ 5 ng/µL Summa summa ≥ 80 ng Nanogutta OD260/280=1.6-2.5 Gel agarosum: nulla vel parva degradatio vel contaminatio
|
Selectio Materiarum
Varietates diversae, subspecies, stirpes locales/bancae genorum/familiae mixtae/res silvestres
Varietates diversae, subspecies, stirpes locales
Familia semifratrum/familia plenae fratris/res silvestres
Fluxus Operis Servitii
Designatio experimenti
Traditio speciminis
Extractio ARN
Constructio bibliothecae
Sequentiatio
Analysis datorum
Officia post-venditionis
Hanc analysin includit:
- Analysis associationis totius genomi: exemplar LM, LMM, EMMAX, FASTLMM
- Annotatio functionalis genorum candidatorum
Analysis associationis SNP-proprietatis – diagramma Manhattanense
Analysis associationis SNP-proprietatis – diagramma QQ
Explora progressus a officiis BMKGene de GWAS adiutos per collectionem curatam publicationum:
Lv, L. et al. (2023) 'Perspicientia in fundamenta genetica tolerantiae ammoniae in *Sinonovacula constricta* per studium associationis totius genomi'.Aquacultura*, 569, p. 739351. doi: 10.1016/J.AQUACULTURE.2023.739351.*
Li, X. et al. (2022) 'Analyses multi-omicae 398 accessionum milii vulpini regiones genomicas cum domesticatione, notis metabolitis, et effectibus anti-inflammatoriis consociatas revelant'.Planta Molecularis, 15(8), pp. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.
Li, J. et al. (2022) 'Delineatio Associationis Totius Genomatis Phaenotyporum Vix Hulless in Ambiente Sicco',Fines in Scientia Plantarum13, p. 924892. doi: 10.3389/FPLS.2022.924892/BIBTEX.
Zhao, X. et al. (2021) 'GmST1, quod sulfotransferasem codificat, resistentiam contra stirpes G2 et G3 virus mosaici soiae confert',Planta, Cellula et Ambitus, 44 (8), pp. doi: 10.1111/PCE.14066.
