Longa Sequentiatio Non-Codans-Illumina
Commoda Servitii
●Analysis coniuncta mRNA et lncRNAConiungendo quantificationem transcriptionum mRNA cum studio lncRNA et scoporum eorum, fieri potest ut profunda comprehensio mechanismi regulatorii subiacentis responsioni cellulari obtineatur.
●Peritia AmplaPlus quam 230 000 exempla tractavimus, varia exemplarium et proposita inceptorum comprehendentes. Divitiam peritiae ad omne inceptum afferimus.
●Analysis coniuncta mRNA et lncRNAQuantificationem transcriptionum mRNA cum studio lncRNA et scoporum eorum coniungimus, quod permittit ut conspectus profundior mechanismi regulatorii subiacentis responsioni cellulari obtineatur.
●Rigorosa Qualitatis InspectioPuncta moderationis fundamentalia per omnes gradus, a praeparatione exemplorum ad bibliothecam, ordinationem et bioinformaticam, adhibemus. Nostra vigilantia accurata efficit ut constanter eventus summae qualitatis proveniant.
●Annotatio ComprehensivaPluribus databasibus utimur ad Gena Differentialiter Expressa (DEGs) functionaliter annotanda et correspondentes analyses locupletationis peragendas. Haec methodus comprehensiva perspicientiam in processus cellulares et moleculares subiacentes responso transcriptomi praebet, tibi omnes informationes possibiles de datis experimenti tui obtinendas curans.
●Auxilium Post-VenditionisIntellegimus quam magni momenti sit praesentiam esse, quam ob rem nostra obligatio ultra completionem operis extenditur cum spatio trium mensium servitii post-venditionis. Hoc tempore, offerimus subsequentia operis, auxilium in solvendis difficultatibus, et sessiones interrogationum et responsionum ad quaslibet quaestiones de eventibus tractandas.
Requisita Exemplorum et Traditio
| Bibliotheca | Platform | Data commendata | QC datorum |
| Bibliotheca directionalis rRNA depleta | Illumina PE150 | 10-16 Gigabytes | Q30≥85% |
Nucleotida:
| Concentratio (ng/μl) | Quantitas (μg) | Puritas | Integritas |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Contaminatio proteinorum vel DNA limitata vel nulla in gel ostenditur. | RIN ≥ 6.0; 5.0 ≥28S/18S ≥1.0; elevatio lineae basalis limitata vel nulla |
● Plantae:
Radix, Caulis vel Petala: 450 mg
Folium vel Semen: 300 mg
Fructus: 1.2 g
● Animal:
Cor vel Intestinum: 450 mg
Viscera vel Cerebrum: 240 mg
Musculus: 600 mg
Ossa, Capilli vel Cutis: 1.5g
● Arthropoda:
Insecta: 9g
Crustacea: 450 mg
● Sanguis integer:Duo tubi
● Cellulae: 106 cellulae
● Serum et Plasma6 mL
Traditio Exemplaris Commendata
Vas: Tubus centrifugae 2 ml (charta stannea non commendatur)
Exemplum designationis: Coetus + replicatio, e.g. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Naviculatio:
1. Glacies sicca: Exempla in saccis conficienda et in glacie sicca sepelienda sunt.
2. Tubi RNAstabilia: Exempla RNA in tubo stabilizationis RNA (e.g. RNAstable®) siccari et temperatura ambiente transportari possunt.
Fluxus Operis Servitii
Designatio experimenti
Traditio speciminis
Extractio ARN
Constructio bibliothecae
Sequentiatio
Analysis datorum
Officia post-venditionis
Bioinformatica
- Data cruda
- QC datorum
- Ordinatio genomatis
- Structura genorum (splicing alternativum, optimizatio structurae genorum et praedictio genorum novorum)
- Quantificatio expressionis genicae
- Analysis expressionis differentialis
- Annotatio et locupletatio DEG + gena lncRNA differentialiter expressa
- Identificatio transcriptionis
- Identificatio lncRNA (conservatio lncRNA et lncRNA nota)
- Praedictio genorum scoporum lncRNA
- Quantificatio expressionis lncRNA
- Analysis coniuncta cum datis mRNA
Analysis Expressionis Genicae Differentialis (DEGs)
Quantificatio expressionis lncRNA – coacervatio
Ditatio genorum lncRNA destinatorum
Analysis situs mRNA et lncRNA coniuncti – diagramma Circos (circulus medius mRNA est et circulus interior lncRNA est)
Explora progressus a servitiis BMKGene ad lncRNA sequentiandum adiutos per collectionem curatam publicationum.
Ji, H. et al. (2020) 'Identificatio, praedictio functionalis, et verificatio clavis lncRNA lncRNA tensionis frigidae conexorum in hepate rattorum'.Relationes Scientificae2020 10:1, 10(1), pp. 1–14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. et al. (2021) 'Analysis Transcriptomica Integrativa Mechanismum Immunitatis Stirpis Cyprini Communis CyHV-3-Resistentis Revelat',Fines in Immunologia, XII, p. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Wang, XJ et al. (2022) 'Prioritas Retium Regulationis RNA Endogenae Certantium in Cancro Pulmonis Parvocellulari Fundata in Integratione Multi-Omica: Characteres Moleculares et Candidati Medicamentorum',Fines in Oncologia, XII, p. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xiao, L. et al. (2020) 'Dissectio genetica retiaculi coexpressionis genorum subiacentis photosyntheseos in Populo'.Acta Biotechnologiae Plantarum*Acta Diurna*, 18(4), pp. 1015–1026. doi: 10.1111/PBI.13270.
Zheng, H. et al. (2022) 'Rete Regulativum Globale pro Expressione Genorum Inordinata et Signatione Metabolica Abnormi in Cellulis Immunitatis in Microambitu Morbi Graves et Thyroiditidis Hashimoto',Fines in Immunologia, XIII, p. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
