პროდუქტები

დნმ/რნმ თანმიმდევრობა – Nanopore Sequencer

ONT თანმიმდევრობა არის ერთი მოლეკულის რეალურ დროში ელექტრული სიგნალის თანმიმდევრობის ტექნოლოგია, რომელიც დაფუძნებულია ნანოფორებზე, თითოეული პლატფორმის თანმიმდევრობის პრინციპი იგივეა.ორჯაჭვიანი დნმ/რნმ დაუკავშირდება ნანოფოროვან ცილას, რომელიც ჩაშენებულია ბიოფილმში და იხსნება საავტომობილო ცილის ტყვიის ქვეშ, ბიოფილმის ორივე მხრიდან ძაბვის სხვაობის ზემოქმედებით, დნმ/რნმ-ის ძაფები გადის ნანოპორული არხის პროტეინს გარკვეულ დროს. განაკვეთი.დნმ/რნმ-ის ჯაჭვზე სხვადასხვა ბაზის ქიმიური თვისებების განსხვავებების გამო, როდესაც ერთი ფუძე ან დნმ-ის მოლეკულა გადის ნანოპურ არხზე, ეს გამოიწვევს სხვადასხვა ელექტრული სიგნალების შეცვლას.ამ სიგნალების გამოვლენით და შესაბამისი ბაზის ტიპების გამოთვლა და თანმიმდევრობის რეალურ დროში აღმოჩენა შეიძლება დასრულდეს.

Დაგვიკავშირდით

სერვისის დეტალები

დემო შედეგი

სერვისის დეტალების მახასიათებლები

Პლატფორმა	ბიბლიოთეკის ზომა	თეორიული მონაცემების გამოსავალი (უჯრედზე)	ერთბაზის სიზუსტე	აპლიკაციები
ნანოპორი	8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR	70-90 გბ / უჯრედი	85-92%	SV გამოძახება, De novo, სრულმეტრაჟიანი თანმიმდევრობა, Iso-Seq, გენის ანოტაცია, დნმ-ის მეთილაციის გამოვლენა

სერვისის უპირატესობები

● PacBio თანმიმდევრობის პლატფორმაზე 5 წელზე მეტი ხნის გამოცდილება ათასობით დახურულ პროექტში სხვადასხვა სახეობებით.
● BMKGENE არის Oxford Nanopore-ის ოფიციალური პარტნიორი, ორმაგი პლატფორმის რნმ/დნმ სერთიფიკატით.
● არსებობს სეკვენსერების ძირითადი მოდელები სრული აღჭურვილობით და საკმარისი თანმიმდევრობის გამტარუნარიანობით.
● Nanopore პლატფორმაზე დაფუძნებული, ცხოველთა და მცენარეთა 10-ზე მეტი კვლევა Denovo-ზე გამოქვეყნდა საერთაშორისო ცნობილ ჟურნალებში.

ნიმუშის მოთხოვნები

ნიმუშის ტიპი

თანხა

კონცენტრაცია (Qubit ®)

მოცულობა

სიწმინდე

სხვები

გენომის დნმ

დამოკიდებულია მონაცემთა მოთხოვნაზე

≥20ნგ/მკლ

≥15მკლ

OD260/280=1.7-2.2;

OD260/230≥1.5；

გამჭვირვალე პიკი 260 ნმ-ზე, დაბინძურების გარეშე

კონცენტრაცია უნდა გაიზომოს Qubit-ით და Qubit/Nanopore ≤ 2-ით

სულ რნმ

≥1.2მკგ

≥100μg/μl

≥15მკლ

OD260/280=1.7-2.5;

OD260/230=0.5-2.5; დაბინძურების გარეშე

RIN მნიშვნელობა ≥7,5

სერვისის სამუშაო პროცესი

ნიმუშის მომზადება

ბიბლიოთეკის მშენებლობა

თანმიმდევრობა

Მონაცემთა ანალიზი

პროექტის მიწოდება

წინა: დნმ/რნმ თანმიმდევრობა – Illumina Sequencer

შემდეგი: Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF-Seq)

დნმ-ის ნიმუშის მონაცემთა ხარისხის შეფასება

ცხრილი 1. სტატისტიკა სუფთა მონაცემების შესახებ.

BMKID	rawSeqNum	rawSumBase	cleanSeqNum	cleanSumBase	სუფთაN50Len	სუფთაN90Len	cleanMeanLen	cleanMaxLen	cleanMeanQual
დნმ_BMK01	1,218,239	26.37	1,121,736	25.90	28014	15764	23 090	143,181	9

რნმ ნიმუშის მონაცემთა ხარისხის შეფასება

ცხრილი 1. სტატისტიკა სუფთა მონაცემების შესახებ.

Ფაილის სახელი	კლიენტის ID	წაკითხვის ნომერი	BaseNum	N50	საშუალო სიგრძე	Მაქსიმალური სიგრძე	MeanQscore
RNA_BMK001	C2	8,947,708	4,047,230,083	398	452	129,227	Q12