პროდუქტები

დნმ/რნმ -ის თანმიმდევრობა - ნანოპორის მიმდევარი

დნმ/რნმ -ის თანმიმდევრობა - Nanopore Sequencer გამორჩეული სურათი

ONT თანმიმდევრობა არის ერთჯერადი მოლეკულის რეალურ დროში ელექტრული სიგნალის თანმიმდევრობის ტექნოლოგია, რომელიც დაფუძნებულია ნანოპორებზე, თითოეული პლატფორმის თანმიმდევრობის პრინციპი ერთნაირია. ორმაგი სტრიქონი დნმ/რნმ შედის ბიოფილმში ჩასმული ნანოპოროზული ცილისა და საავტომობილო ცილის ტყვიის ქვეშ, ძაბვის მოქმედების ქვეშ, ბიოფილმის ორივე მხრიდან, დნმ/რნმ-ის ძაფები გადის ნანოპორის არხის ცილის გავლით გარკვეულწილად შეფასება. დნმ/რნმ -ის ძაფზე სხვადასხვა ბაზების ქიმიური თვისებების განსხვავებების გამო, როდესაც ერთი ბაზა ან დნმ -ის მოლეკულა გადის ნანოპორის არხში, ეს გამოიწვევს სხვადასხვა ელექტრული სიგნალის შეცვლას. ამ სიგნალების გამოვლენით და შესაბამისობით, შეიძლება გამოითვალოს შესაბამისი ბაზის ტიპები, ხოლო თანმიმდევრობის რეალურ დროში გამოვლენა შეიძლება დასრულდეს.

დაგვიკავშირდით

მომსახურების დეტალები

დემო შედეგი

მომსახურების დეტალების მახასიათებლები

სცენა	ბიბლიოთეკის ზომა	თეორიული მონაცემთა მოსავლიანობა (თითო უჯრედში)	ერთჯერადი სიზუსტე	პროგრამები
ნანოპორი	8KB, 10KB, 20KB, Ultralong, cDNA-PCR	70-90GB/უჯრედი	85-92%	SV ზარი, დე ნოვო, სრულმეტრაჟიანი თანმიმდევრობა, ISO-Seq, გენის ანოტაცია, დნმ მეთილის გამოვლენა

მომსახურების უპირატესობები

● 5 წელზე მეტი ხნის გამოცდილება Pacbio– ს თანმიმდევრობის პლატფორმაზე ათასობით დახურული პროექტით სხვადასხვა სახეობით.
● Bmkgene არის ოქსფორდის ნანოპორის ოფიციალური პარტნიორი, ორმაგი პლატფორმის RNA/დნმ სერთიფიკატით.
● არსებობს მიმდევრების ძირითადი მოდელები სრული აღჭურვილობით და საკმარისი თანმიმდევრობის გამტარუნარიანობით.
Nanopore პლატფორმის საფუძველზე, ცხოველთა და მცენარეთა 10 -ზე მეტი გამოკვლევა გამოქვეყნდა საერთაშორისო მასშტაბით ცნობილ ჟურნალებში.

ნიმუშის მოთხოვნები

ნიმუშის ტიპი

თანხა

კონცენტრაცია (qubit ®)

ტომი

სიწმინდე

სხვები

გენომი დნმ

დამოკიდებულია მონაცემთა მოთხოვნაზე

≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280 = 1.7-2.2;

OD260/230≥1.5 ；

წმინდა მწვერვალი 260 ნმ -ზე არ არის დაბინძურება

კონცენტრაციის გაზომვა საჭიროა qubit და qubit/nanopore ≤ 2

სულ რნმ

.21.2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280 = 1.7-2.5;

OD260/230 = 0.5-2.5 ； არ არის დაბინძურება

RIN მნიშვნელობა ≥7.5

სამსახურის სამუშაო ნაკადი

ნიმუშის მომზადება

ბიბლიოთეკის მშენებლობა

თანმიმდევრობა

მონაცემთა ანალიზი

პროექტის მიწოდება

წინა: Illumina წინასწარ დამზადებული ბიბლიოთეკები

შემდეგი: სპეციფიკური ლოკუსის გამაძლიერებელი ფრაგმენტის თანმიმდევრობა (SLAF-SEQ)

დნმ -ის ნიმუშის მონაცემთა ხარისხის შეფასება

ცხრილი 1. სტატისტიკა სუფთა მონაცემების შესახებ.

ბმკიდი	Rawseqnum	Rawsumbase	CleanSeqnum	წმენდა	Cleann50Len	Cleann90Len	წმენდა	სუფთა maxlen	წმინდა
Dna_bmk01	1,218,239	26.37	1,121,736	25.90	28,014	15,764	23,090	143,181	9

რნმ -ის ნიმუშის მონაცემთა ხარისხის შეფასება

ცხრილი 1. სტატისტიკა სუფთა მონაცემების შესახებ.

ფაილის სახელი	კლიენტი IID	წაკითხული	ბასენუმი	N50	საშუალო სიგრძე	მაქსიმალური სიგრძე	Meanqscore
RNA_BMK001	C2	8,947,708	4,047,230,083	398	452	129,227	Q12