BMKCloud Log in
banner-03

Mahsulotlar

DNK/RNK ketma-ketligi - Nanopor sekvenseri

ONT ketma-ketligi nanoporlarga asoslangan yagona molekulali real vaqtda elektr signallarini ketma-ketlashtirish texnologiyasi bo'lib, har bir platformaning ketma-ketlik printsipi bir xil.Ikki zanjirli DNK/RNK biofilmga joylashtirilgan nano gözenekli oqsil bilan bog'lanadi va motor oqsili qo'rg'oshin ostida ochiladi, biofilmning har ikki tomonidagi kuchlanish farqi ta'sirida DNK/RNK zanjirlari ma'lum bir tezlikda nanoporoz kanal oqsili orqali o'tadi. darajasi.DNK/RNK zanjiridagi turli asoslarning kimyoviy xossalarining farqi tufayli, bitta asos yoki DNK molekulasi nanopor kanali orqali o'tganda, bu turli xil elektr signallarining o'zgarishiga olib keladi.Ushbu signallarni aniqlash va ularga mos kelish orqali tegishli tayanch turlarini hisoblash va ketma-ketlikni real vaqtda aniqlashni yakunlash mumkin.


Xizmat tafsilotlari

Demo natijasi

Xizmat tafsilotlari xususiyatlari

Platforma

Kutubxona hajmi

Nazariy maʼlumotlar rentabelligi (Har bir hujayra uchun)

Yagona asosli aniqlik

Ilovalar

Nanopor

8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR

70-90 Gb/uyali

85-92%

SV chaqiruvi, De novo, To'liq uzunlikdagi ketma-ketlik, Iso-Seq, Gen izohi, DNK metilatsiyasini aniqlash

Xizmat afzalliklari

● Har xil turlar bilan minglab yopiq loyihalar bilan PacBio sequencing platformasida 5 yildan ortiq tajriba.
● BMKGENE ikki platformali RNK/DNK sertifikatiga ega Oksford Nanopore kompaniyasining rasmiy hamkori hisoblanadi.
● To'liq uskuna va etarli ketma-ketlik o'tkazuvchanligiga ega bo'lgan sekvenserlarning asosiy modellari mavjud.
● Nanopore platformasi asosida Denovoning 10 dan ortiq hayvon va o‘simlik tadqiqotlari xalqaro miqyosdagi mashhur jurnallarda chop etilgan.

Namuna talablari


Namuna turi

Miqdori

Konsentratsiya (Qubit ®)

Ovoz balandligi

Tozalik

Boshqalar

Genomik DNK

Ma'lumotlarga bo'lgan talabga bog'liq

 ≥20ng/ml

≥15ml

OD260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1,5;

260 nm da aniq cho'qqi, ifloslanish yo'q

Konsentratsiyani Qubit va Qubit/Nanopore ≤ 2 bilan o'lchash kerak

Jami RNK

≥1,2 mkg

≥100 mkg/ml

≥15ml

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5; ifloslanish yo'q

RIN qiymati ≥7,5

 

Xizmat ish jarayoni

namuna tayyorlash

Namuna tayyorlash

Kutubxonaga tayyorgarlik

Kutubxona qurilishi

Ketma-ketlik

Ketma-ketlik

Ma'lumotlarni tahlil qilish

Ma'lumotlarni tahlil qilish

QC namunasi

Loyihani yetkazib berish


  • Oldingi:
  • Keyingisi:

  • DNK namunasining ma'lumotlar sifatini baholash

    Jadval 1. Toza ma'lumotlar bo'yicha statistika.

    BMKID

    rawSeqNum

    rawSumBase

    cleanSeqNum

    cleanSumBase

    cleanN50Len

    cleanN90Len

    cleanMeanLen

    cleanMaxLen

    cleanMeanQual

    DNA_BMK01

    1 218 239

    26.37

    1 121 736

    25.90

    28 014

    15 764

    23 090

    143,181

    9

    RNK namunasining ma'lumotlar sifatini baholash

    Jadval 1. Toza ma'lumotlar bo'yicha statistika.

    Fayl nomi

    ClientID

    ReadNum

    BaseNum

    N50

    O'rtacha uzunlik

    Maksimal uzunlik

    O'rtacha Qscore

    RNA_BMK001

    C2

    8 947 708

    4 047 230 083

    398

    452

    129,227

    12-savol

    Shakl 1. O'qish uzunligi taqsimoti

    A3

    Shakl 2. Toza ma'lumotlarning sifat ball taqsimoti

    A4

    Shakl 3. Toza ma'lumotlarning uzunligi va sifat ball taqsimoti

    A5

    taklif oling

    Xabaringizni shu yerga yozing va bizga yuboring

    Bizga xabaringizni yuboring: