Ama ejije | Ọbá akwụkwọ | Ntinye data (kwa sel) | Otu-isi mmalite | Ngwa |
Nanopore | 8KB, 10KB, 20KB, Ultralong, Cdna-pcr | 70-90GB / Cell | 85-92% | SV na-akpọ, De Novo, sequen zuru oke, ISO-SEQ, Ihe ọmụmụ Gene, nchọpụta nke DNNA |
Ihe karịrị afọ 5 ruo afọ 5 na Pacbio na-achọ ikpo okwu nwere puku nwere ọtụtụ puku ndị ọrụ emechiri emechi na ụdị dị iche iche.
BMKGEE bụ onye ọrụ onye ọrụ nke Oxford Nanopore, na asambodo eji eme ihe.
E nwere ụdị nke ihe na - eji akụrụngwa zuru oke wee nweta usoro zuru ezu.
● E bipụtawo na ntanetị nanopore, ihe karịrị anụmanụ 10 na osisi a kọrọ akụkọ ama ama na akwụkwọ akụkọ a na-akpọ.
Ụdị atụ | Ego | Nchọpụta (Qubit ®) | Ibu | Nko | Ndi ozo |
Gnamic DNA | Dabere na ihe achọrọ | ≥20ng / μl | ≥15μl | OD260 / 280 = 1.7-2.2; OD260 / 230≥1.5; O doro anya na 260 nm, enweghị mmerụ | Inwe ochicho choro ka atumatu ya na Qubit / Nanopore ≤ 2 |
Ngụkọta rna | ≥1.2μμG | ≥100G / μl | ≥15μl | OD260 / 280 = 1.7-2.5; OD260 / 230 = 0.5-2.5; Ọ dịghị ihe mgbochi | Rin Uru ≥7.5 |
Nyocha data nke DNA
Tebụl 1. Ndekọ ọnụ ọgụgụ na data dị ọcha.
Bmkid | rawseqnum | Rawskase | sachapụ-um | nhicha dị ọcha | nhicha dị ọcha | Breshn90len | Brichanmeanlen | BreatMaxlen | dichachaqual |
DNA_BMK01 | 1,218,239 | 26.37 | 1,121,736 | 25.90 | 28,014 | 15,764 | 23,090 | 143,181 | 9 |
Nyocha data nke RNA
Tebụl 1. Ndekọ ọnụ ọgụgụ na data dị ọcha.
Aha faịlụ | Kaaki | Gụọnkum | Basenum | N50 | Pụtara ifelata | Otutu oge | Ihe putara |
RNA_BMK001 | C2 | 8,947,708 | 4,047,230,083 | 398 | 452 | 129,227 | Q12 |
Ọgụgụ 1. Gụọ ogologo nkewa
Ọgụgụ 2. Ogo akara nke data dị ọcha
Ọgụgụ 3. Ogologo na ogo nkesa nke data dị ọcha