-
Nyocha gbasara mkpokọta Genome
Ọmụmụ ihe gbasara njikọ genome-wide (GWAS) na-achọ ịchọpụta ụdị mkpụrụ ndụ ihe nketa (genotype) nke jikọtara ya na njirimara ụfọdụ (phenotype).Ọmụmụ GWAS na-enyocha akara mkpụrụ ndụ ihe nketa na-agafe genome nke ọnụ ọgụgụ mmadụ buru ibu ma buru amụma banyere mkpakọrịta genotype-phenotype site na nyocha ndekọ ọnụ ọgụgụ na ọkwa ọnụ ọgụgụ mmadụ.A tinyela ya n'ọrụ n'ọtụtụ ebe n'ime nyocha gbasara ọrịa mmadụ na ngwuputa mkpụrụ ndụ ihe nketa na-arụ ọrụ na àgwà mgbagwoju anya nke anụmanụ ma ọ bụ osisi.
-
Usoro RNA otu nucleus
Ọganihu n'ime otu cell na usoro iwu ụlọ ọba akwụkwọ jikọtara ya na usoro ntinye dị elu na-enye ohere ọmụmụ mkpụrụ ndụ ihe nketa site na cell site na cell.Ọ na-eme ka nyocha nke sistemu dị omimi na nke zuru oke na ọnụ ọgụgụ sel dị mgbagwoju anya, nke ọ na-ezere nkpuchi nke ịdị iche iche ha site na iwere nkezi nke sel niile.
Otú ọ dị, ụfọdụ mkpụrụ ndụ adịghị mma ka e mee ya ka ọ bụrụ nkwusioru nke otu cell, ya mere, usoro nkwadebe ihe atụ ndị ọzọ - a na-ewepụta oghere site na anụ ahụ, ya bụ, a na-esi na anụ ahụ ma ọ bụ cell ewepụta ngwa ngwa ma kwadebe ya n'otu nkwusioru maka otu-nucleus. usoro cell.
BMK na-enye 10× Genomics ChromiumTM nke dabere na otu cell RNA ọrụ usoro.A na-eji ọrụ a eme ihe n'ọtụtụ ebe n'ọmụmụ ihe gbasara ọmụmụ ihe metụtara ọrịa, dị ka ọdịiche dị n'etiti cell immunodeficiency, ụdị ọrịa tumor, mmepe anụ ahụ, wdg.
Mgbawa transcriptome spatial: 10× Genomics
Platform: Illumina NovaSeq Platform
-
Usoro ihe ọkụkụ/anụmanụ dum genome
Usoro nhazigharị genome dum, nke a makwaara dị ka WGS, na-enyere aka ikpughe ma mmụgharị nkịtị na nke na-adịghị ahụkebe na genome niile gụnyere Single Nucleotide Polymorphism (SNP), Nhichapụ ntinye (InDel), mgbanwe nhazi (SV), na Ụdị Ntugharị nọmba (CNV). ).SV na-eme ka akụkụ dị ukwuu nke isi mgbanwe dị iche iche karịa SNP ma nwee mmetụta dị ukwuu na genome, nke nwere mmetụta dị ukwuu na ihe ndị dị ndụ.Ịgụgharị ogologo oge na-enye ohere ịmatakwu nkenke nke nnukwu iberibe na ọdịiche dị mgbagwoju anya n'ihi na ogologo oge na-agụ na-eme ka ọ dịkwuo mfe ịgafe chromosomal na mpaghara mgbagwoju anya dị ka tandem na-emegharị, GC/AT-ọgaranya mpaghara, na mpaghara hyper-variable.
Platform: Illumina, PacBio, Nanopore
-
BMKMANU S1000 Spatial Transcriptome
Nhazi sel nke oghere na-arụ ọrụ dị mkpa na usoro ndu dị iche iche, dị ka ntinye mgbochi ọrịa, mmepe embrayo, wdg. Usoro transcriptome spatial transcriptome, nke na-egosi ịkọwapụta mkpụrụ ndụ ihe nketa ka ọ na-ejigide ozi nke ọnọdụ oghere, enyela nnukwu nghọta na nhazi anụ ahụ nke transcriptome-larịị.Site na mmepe nke teknụzụ, ọ dị mkpa iji mkpebi dị elu mụọ ihe omimi anụ ahụ doro anya na ezigbo ọdịiche dị na mbara ala.BMKGENE na-enye ọrụ transcriptome transcriptome zuru oke, otu nkwụsị site na nlele ruo na nghọta ndu.
Teknụzụ transcriptomics gbasara ohere nyere ikike echiche ọhụụ na mpaghara nyocha dị iche iche site na idozi profaịlụ mkpụrụ ndụ ihe nketa na ọdịnaya oghere n'ụdị nlele dị iche iche.
Mgbawa transcriptome nke oghere: BMKMANU S1000
Platform: Illumina NovaSeq Platform
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
Visium Spatial Gene Expression bụ teknụzụ usoro transcriptome nke na-agbasa mbara igwe maka ịhazi anụ ahụ dabere na mkpokọta mRNA.Jiri ọnọdụ ọdịdị ọdịdị dị n'usoro maapụ transcriptome niile iji chọpụta nghọta ọhụrụ gbasara mmepe nkịtị, ọrịa ọrịa, na nyocha ntụgharị asụsụ ụlọ ọgwụ.BMKGENE na-enye ọrụ transcriptome transcriptome zuru oke, otu nkwụsị site na nlele ruo na nghọta ndu.
Teknụzụ transcriptomics gbasara ohere nyere ikike echiche ọhụụ na mpaghara nyocha dị iche iche site na idozi profaịlụ mkpụrụ ndụ ihe nketa na ọdịnaya oghere n'ụdị nlele dị iche iche..
Mgbawa transcriptome spatial: 10x Genomics Visium
Platform:Illumina NovaSeq Platform
-
Usoro mRNA dị ogologo-Nanopore
Usoro RNA abụrụla ngwa bara uru maka nyocha transcriptome zuru oke.Obi abụọ adịghị ya, usoro ọgụgụ dị mkpirikpi ọdịnala nwetara ọtụtụ mmepe dị mkpa na ebe a.Ka o sina dị, ọ na-ezutekarị mmachi na njirimara isoform ogologo zuru oke, nha, echiche PCR.
Usoro Nanopore na-ekewa onwe ya na usoro nhazi usoro ndị ọzọ, n'ihi na a na-agụ nucleotides ozugbo na-enweghị njikọ DNA ma na-emepụta ogologo oge na iri puku kilobases.Nke a na-enye ike ịgụ akwụkwọ ozugbo na-agafe transcript zuru oke yana imeri ihe ịma aka ndị dị na ọmụmụ ọkwa-isoform.
Platform:Ọnụ ego nke Nanopore PromethION
Ụlọ akwụkwọ:cDNA-PCR
-
Usoro mRNA zuru oke -PacBio
De novousoro transcriptome zuru oke, nke a makwaara dị kaDe novoIso-Seq na-ewere uru nke PacBio sequencer n'ogologo ọgụgụ, nke na-eme ka usoro nke mkpụrụ ndụ cDNA dị ogologo na-enweghị nkwụsịtụ ọ bụla.Nke a na-ezere kpam kpam njehie ọ bụla ewepụtara na usoro mgbakọ transcript wee wulite unigene sets na mkpebi ọkwa ọkwa isoform.Usoro unigene a na-enye ozi mkpụrụ ndụ ihe nketa siri ike dị ka “genome ntụaka” na ọkwa transcriptome.Na mgbakwunye, ijikọ na data usoro usoro ọgbọ na-abịa, ọrụ a na-enye ike njupụta ziri ezi nke nkwupụta ọkwa isoform.
Platform: PacBio Sequel IIỌbá akwụkwọ: SMRT mgbịrịgba ọba akwụkwọ -
Eukaryotic mRNA Sequencing-Ilumina
usoro mRNA na-enyere aka ịkọwapụta mRNA niile edere site na sel n'okpuru ọnọdụ akọwapụtara.Ọ bụ teknụzụ siri ike maka ikpughe profaịlụ mkpụrụ ndụ ihe nketa, usoro mkpụrụ ndụ ihe nketa na usoro mkpụrụ ndụ nke ụfọdụ usoro ndu.Ruo ugbu a, a na-arụ ọrụ mRNA usoro n'ọtụtụ ebe na nyocha dị mkpa, nchọpụta ụlọ ọgwụ, mmepe ọgwụ, wdg.
Platform: Illumina NovaSeq Platform
-
Usoro mRNA na-abụghị nke nrụtụ aka-Ilumina
usoro mRNA na-anabata usoro usoro usoro ọgbọ na-abịa (NGS) iji weghara onye ozi RNA (mRNA) na-etolite Eukaryote n'oge akọwapụtara nke ụfọdụ ọrụ pụrụ iche na-arụ ọrụ.A na-akpọ transcript kachasị ogologo nke spliced 'Unigene' ma jiri ya dị ka usoro ntụaka maka nyocha na-esote, nke bụ ụzọ dị irè iji mụọ usoro molekul na netwọk nchịkwa nke ụdị ahụ na-enweghị ntụle.
Mgbe mgbakọ data transcriptome na nkọwa ọrụ unigene gasịrị
(1) A ga-ahazi nyocha SSR, amụma CDS na usoro mkpụrụ ndụ ihe nketa.
(2) A ga-eme ọnụọgụ nke okwu unigene na nlele ọ bụla.
(3) A ga-achọpụta unigenes dị iche iche egosipụtara n'etiti nlele (ma ọ bụ otu) dabere na nkwupụta unigene.
(4) A ga-eme nchịkọta, nkọwa ọrụ na nyocha ịba ụba nke unigenes dị iche iche.
-
Ogologo usoro enweghị koodu-Ilumina
Ogologo RNA ndị na-abụghị koodu (lncRNAs) bụ ụdị mkpụrụ ndụ RNA nwere ogologo karịa 200 nt, nke ejiri ikike nzuzo dị oke ala mara.LncRNA, dị ka onye bụ isi na RNA ndị na-abụghị koodu, ka a na-ahụkarị na oghere na plasma.Mmepe nke usoro teknụzụ na bioinfortics na-enyere aka ịchọpụta ọtụtụ lncRNA ọhụrụ ma jikọta ndị nwere ọrụ ndu.Ihe akaebe gbasara mkpokọta na-egosi na lncRNA na-etinye aka na usoro epigenetic, ụkpụrụ ndebanye aha na ụkpụrụ post-transcription.
-
Obere usoro RNA-Ilumina
Obere RNA na-ezo aka na klaasị nke ụmụ irighiri ihe RNA na-abụghị koodu nke na-adịkarị obere karịa 200nt n'ogologo, gụnyere micro RNA (miRNA), obere nnyonye anya RNA (siRNA), na RNA (piRNA) na-emekọrịta ihe.
MicroRNA (miRNA) bụ klaasị nke obere RNA endogenous nwere ogologo ihe dịka 20-24nt, nke na-arụ ọrụ nhazi dị iche iche na sel.miRNA na-etinye aka n'ọtụtụ usoro ndụ nke na-ekpughe anụ ahụ - kpọmkwem na ogbo - nkwupụta akọwapụtara yana echekwara nke ukwuu n'ụdị dị iche iche.
-
usoro nke circRNA-Ilumina
CircRNAs (RNA okirikiri) bụ otu klaasị nke ụmụ irighiri ihe RNA na-abụghị koodu nke dị mkpụmkpụ nke okpu ngwụcha 5 na 3′ njedebe poly(A).CircRNA na-arụ usoro okirikiri site na njikọ covalent nke bụ ọkwa megide mgbaze RNA exonuclease.circRNA na-arụ ọrụ dị mkpa na uto na mmepe nke ihe ndị dị ndụ na iguzogide ha na gburugburu ebe obibi.
CircRNA nwere ọtụtụ ọrụ, nke nwere ike jikọta miRNA nke ọma, na-arụ ọrụ nhazi nke ceRNA, iji chịkwaa mkpụrụ ndụ ihe nketa.N'ime afọ ndị na-adịbeghị anya, a chọpụtakwara na ọ nwere njikọ chiri anya na ihe omume na mmepe nke ọrịa, ma nwee nnukwu atụmanya ngwa na ntụziaka nke ihe nrịbama ọrịa na ihe ndị ọzọ.
